最后一届领导班子成员:荫昌、载振、载洵、铁良、载涛、载润等。
第一次失败后,满蒙独立运动继续秘密进行。1913年,福井雅太郎少将调任关东都督府参谋长后,这一运动得到了进一步的发展。满蒙独立运动的中心人物川岛浪速,这时又抛出了一个《对支管见》,向政府及各有关部门,大力宣传满蒙独立的必要。1916年2月,政友会、同志会、国民党、中正会各党派以及国民外交同盟会、对华联合会、浪人会等民间团体,召开了“对支有志大会”,通过了反对袁世凯的宣言。当时日本大隈内阁在对华政策上,采取多边倒袁的方针,使中国陷于混乱,趁机分割中国领土,并进一步控制中国。同年3月,大隈首相召开内阁会议,决定对华采取如下方针:要确立帝国在华的优势,并使中国人自觉的意识到帝国的势力;为达此目的,以袁世凯退出中国当政者集团为妥,毫无疑义,任何人取代袁氏,均比袁氏更有利于帝国;为达此目的,要尽量在中国造成这种形势,而帝国随机适当对处;默认“民间人士”支援中国人的反袁活动。
关东都督中村觉大将根据政府的这种方针,传令驻满洲各地的领事和官宪,不在取缔日本人的反袁活动。
另一方面,川岛浪速等人在大连拥立肃亲王,招募土匪,秘密组织军队。当时已组成宗社党勤王军2000多人。他们还于1915年夏,同盘踞在内蒙古大布苏诺尔(盐湖)附近的蒙古马队首领巴布扎布取得联系,策动巴布扎布所部与以肃亲王为中心的宗社党相结合,从事满蒙独立活动。当时参加这一活动的日本军人有青柳胜敏(预备役骑兵大尉)、木泽畅(预备役步兵大尉),以及刚刚退伍的工兵大尉入江种矩等人。另外还有大陆政客柴四郎、松平康国、押川方义、大竹贯一、五百木良三等。预备役海军中将上泉德弥也参与了这一阴谋活动。
1915年12月,袁世凯复辟遭到全国反对,陷入灭顶之灾 。日人川岛浪速之流认为时机已到,唆使善耆等宗社党分子与民族分裂主义分子巴布扎布等勾结在一起,拉起叛军,进行分裂中国的罪恶活动 。1916年7月1日,巴布扎布叛匪在日本大尉青抑胜敏的指挥下,率“勤王复国军”3000余人,由呼伦贝尔盟喀尔喀河畔出发,向洮南方向窜扰 。张作霖闻报,除令吴俊升派兵严防以免扰累外,还通电吉、黑两省也要出兵协剿 。张作霖令二十八师派出一旅,由开鲁等地堵截;通知热河都统姜桂题、黑龙江省毕桂芳督军各派精兵,由东北西北方向围剿,吴俊升由南包抄,一举全歼 。
1916年1月下旬,肃亲王之子宪奎王,在青柳的陪同下,前往巴布扎布驻地,联络共通举事。3月,木泽、入江也赶到大连,接着川岛便在大连设置了举事的大本营。
与此同时,参谋本部方面,参谋次长田中义一和刚从关东都督府参谋长调任参谋本部第二部长的福田雅太郎,直接担任幕后指挥。他们把土井市之进大佐、小矶国昭少佐等四人派往中国东北。土井为此次举事的总指挥,他的任务是指挥川岛等人的满蒙独立运动,至少要牵制北方势力,以帮助南方势力的继续发展,如有可能,则使满蒙派与南方派互相呼应,逼近北京;并对于起事所需的资金筹措级武器的购买和运送,多多给以方便;同时指导其军事行动。土井经由朝鲜秘密赴中国东北,把川岛等人划归自己指挥之下,并由大仓喜八郎借给肃亲王100万日元的资金,拨给五千支步枪和八门野炮。土井、川岛等人预定于4月15日举事。
但是,当时日本政府对满蒙的政策又起了分歧。驻中国公使伊集院、驻奉天总领事矢田以及石井外相、田中参谋次长等人,认为川岛的计划是在日本军宪威力掩护之下,试图掀起不成体统之掠夺性小暴动,是没有成功希望的。如果是对于中国军队那样有实力的势力进行内部策反,在此基础上发起有把握的暴动,则另当别论。因而他们认为利用张作霖进行满蒙独立运动,比土井、川岛的计划更为有利。4月10日,田中参谋次长电令关东都督府西川参谋次长要求他和奉天矢田总领事密商,对张作霖进行工作。4月19日,张作霖驱逐了段芝贵,成为代理奉天将军和奉天巡阅使,实现了他多年称霸东北的野心。这时,日本加紧策动独立活动,通过袁金铠、于冲汉以及张的日本顾问菊池武夫中佐等人进行秘密联络,甚至连独立宣言都拟定好了。这一阴谋计划的主要内容是:要求张作霖宣布长城以北的满蒙地区脱离中国,成立在宣统皇帝统治下的独立国家;把宣统皇帝由北京迁到奉天;满蒙独立后和日本签署一项特殊盟约。
另一方面,以中村关东都督为首的土井、小矶、川岛等拥立宗社党肃亲王一派,则反对上述拉拢张作霖的计划,甚至做出炸死张作霖的决定。川岛等人认为张作霖是实现“满蒙独立运动”的最大障碍,决定用暗杀手段除掉他,然后乘乱杀入奉天城,使东北成为“宗社党”的天下 。1916年5月,日本土井少将接到除掉张作霖的密令,马上来到奉天满铁附属地,纠集日本浪人伊达顺之助、三村预备上校等组成“满蒙决死团” 。1916年5月27日,日本关东都督中村觉大将访问奉天,张作霖率其部下汤玉麟等人乘五辆俄式马车赴车站迎接,在返回途中,日本预备役少尉三村丰向一辆马车投掷炸弹,将车炸毁,但张作霖却坐在另一辆马车上,幸免于难。张作霖赶回了将军署,在门口架起了机关枪,卫队也被紧急召集起来,处于戒备状态 。这次暗杀事件给了张作霖一个重要教训,使他懂得,不能不对日本加以防备 。川岛等人的工作继续进行,预定在六月中旬,从奉天开始,在庄河、复州、辽西、本溪湖等地举事。但在6月6日,袁世凯暴死,由黎元洪出任总统,段祺瑞任国务总理。这时,日本不得不停止反袁活动,转而采取援助段祺瑞的方针,以便控制中国。因而,满蒙独立活动也被迫终止。