温州高新技术产业园区的机构设置包括了多个专门负责不同领域的部门，旨在优化管理和服务。这些部门分别是：
党政办公室，承担园区的日常行政管理和党的工作协调。
发展改革和经济局，负责园区的经济发展规划和政策实施。
科技合作局，致力于推动科技创新和技术合作。
财政局（金融办），负责园区的财政预算和金融支持工作。
国土规划建设局，挂有市国土资源局高新区分局和市规划局高新区分局的牌子，负责园区的土地和城市规划管理。
安全生产监督管理局，挂有温州高新技术产业园区安全生产委员会办公室的牌子，确保园区的安全生产环境。
城市管理与环保局，合并了市环保局高新技术产业园区分局和龙湾区城市管理与行政执法局高新技术产业园区分局，负责环保和城市管理工作。
人力资源局，负责园区的人力资源配置和人才培养。
社会工作局，关注园区的社会福利和社区服务。
这些部门共同协作，为温州高新技术产业园区的持续发展提供了有力的支撑和保障。