消毒隔离存在问题原因分析及整改措施如下：
1、环境布局不合理。
实验室环境脏乱差；清洁区、污染区、半污染区划分不明确，可能导致检验科人员、院内医务人员、患者之间的交叉感染。
2、环境保护和用具保护意识不强。
医务人员医院感染意识淡薄，在操作中缺乏消毒隔离意识。分类前未准备好盛装用具、器械串子。盛装着污染器械的容器置于存放清洁物品的区域，用院未极时消毒清洗。
3、执行制度不严。
表现在包装台面不整洁,检查器械清洁度不认真,敷料包装与器械包装同室同时间进行,过期器械未重新清洗，未按要求装载，无菌物品御载时未充分散热造成湿包。启闭式容器未认真检查是否关严密。
整改措施
1、加强护理人员、保洁人员、护工的消毒隔离知识和技能护培训护理人员、保洁人员、护工要进行严格的岗前培训，经考试合格后才能上岗。在工作中不断地接受消毒隔离知识和职业防护教育，加深思想认识，增强防范意识。
医院管理者应建立建全消毒隔离制度和管理措施以及相应操作流程，提供合格的足量的职业防护用品，在工作中进行督导、奖惩，增强工作人员的慎独精神。牢固树立护理人员的无菌观念,严格执行无菌技术操作原则和各项技术操作规范，是减少医院感染发生的重要环节。
2、加强医院感染知识的培训组织工作人员学习相关法律、法规,卫生行业标准等知识,除医院组织的业务培训外，科室还应每月组织学习医院感染的相关知识，使其严格执行各项操作技术规程，并了解和掌握新进展及新技术。
从而自觉遵守医院消毒隔离及相关制度和卫生行业标准，认真履行医院感染管理职责，减少医院感染的发生。
3、加强环节质量管理院感科定期或不定期的对科室进行检查和监测，对其存在问题进行分析并提出合理有效的整改措施。
护士长每天检查消毒隔离和职业防护执行情况，定其组织召开院感防控工作会,通过以制度为目标、以管理为手段、以监测为依据的方法,保证消毒隔离的环节质量,达到预防和控制医院感染的目的。