法律分析：1、在工程所在地地税局缴纳，也可以在机构所在地地税局申报缴纳；2、根据《印花税暂行条例》规定，合同由签订双方各自全额贴花或计算缴纳印花税。《印花税暂行条例》及其实施细则没有规定印花税的纳税地点；只是规定了纳税期限，即在合同签订贴花。通常情况下，工程所在地地税局代开发票时会要您缴纳印花税的。建筑安装工程承包合同，按照承包金额依照万分之三贴花或计算缴纳印花税。
法律依据：《国务院关于废止和修改部分行政法规的决定》
第一条 在中华人民共和国境内书立、领受本条例所列举凭证的单位和个人，都是印花税的纳税义务人（以下简称纳税人），应当按照本条例规定缴纳印花税。
第二条 下列凭证为应纳税凭证：
（一）购销、加工承揽、建设工程承包、财产租赁、货物运输、仓储保管、借款、财产保险、技术合同或者具有合同性质的凭证；
（二）产权转移书据；
（三）营业账簿；
（四）权利、许可证照；
（五）经财政部确定征税的其他凭证。
第三条 纳税人根据应纳税凭证的性质，分别按比例税率或者按件定额计算应纳税额。具体税率、税额的确定，依照本条例所附《印花税税目税率表》执行。