吴健雄班是指由著名物理学家吴健雄创办、以培养高水平创新型人才为目标的一种教育培训项目。其主要包含的专业有：
1. 物理学类：包括理论物理、高能物理、粒子物理、原子分子物理、凝聚态物理等方向。
2. 数学类：包括纯数学、应用数学、概率论与数理统计等方向。
3. 计算机科学与技术类：包括计算机系统结构、计算机网络、软件工程、人工智能等方向。
4. 生命科学类：包括生物物理学、生物信息学、生物化学、细胞生物学等方向。
以上只是吴健雄班主要包含的一些专业方向，具体还可能涉及到其他专业领域的学习和培养。
培养模式
工科试验班（吴健雄班）贯彻“厚基础、宽口径、强交叉、重个性”的方针，学生入校时不分专业，前期按照“筑理工基础、强人文素养、建系统思维”的指导思想，强化通识教育基础和大类学科基础，后期按照“重个性发展、强学科交叉、促学研融合”的指导思想，实施导师指导个性化专业培养。
学生可从全校优秀专家、学者中选择专业导师，在其直接指导下完成专业学习和实践，专业选择范围覆盖四年制理工科类所有专业。学生日常管理由吴健雄学院实施驻院（书院式）导师制管理模式。
管理机制
工科试验班（吴健雄班）学生将由高考单独招生和新生入校遴选组成。除高考直接报考外，已被东南大学录取的理工科专业（类）优秀学生，认同吴健雄学院的培养理念，认同吴健雄学院培养理念，勇于追求崇高目标、立志献身科学事业，可参加吴健雄班遴选。遴选着重考查学生的数理基础、英语能力、综合素质、自我内驱力和身心健康状况。
进入工科试验班（吴健雄班）的学生称为驻院荣誉学生，享有荣誉学籍，进行集中驻院（书院式）管理。学院通过营造博雅向上的书院文化和导师引导相结合，引领学生树立远大的志向，帮助学生身心健康成长。
荣誉学籍采用动态管理，实行滚动进出机制。学院每学期对驻院荣誉学生进行荣誉学籍认定，对不能适应驻院培养模式、未达到荣誉学生条件者，转出荣誉学籍申请按照相关专业培养方案进行学习。其他学院的优秀学生大一学年结束可申请参加转入吴健雄学院学习的遴选，经考核符合条件（标准）者可进入吴健雄学院成为驻院荣誉学生。
工科试验班（吴健雄班）学生所修课程达到所选专业规定的匹配要求，颁发相关专业学位；达到驻院荣誉学生培养基本要求，并充分利用学院导师制、国际化等平台资源完成荣誉课程及项目，授予东南大学“荣誉毕业生证书”，并可直接选择攻读国内外著名大学的研究生。