1.机身不同
6s采用全新的7000系列铝合金，相比于iPhone 6的6063铝合金，强度会有明显提升，拒绝易弯。
6s Plus长宽增加0.1mm，厚度增加0.2mm，整机重量增加20g。
2.背部标识不同
6s首次在机身背面印上“s”字样。IMEI码与4、4s一样印在卡托上。
3.机身边缘不同
开始拆机，6s Plus边缘增加了泡棉胶，提高了屏幕和机身的稳定性密闭性，也增加了拆机难度。
4.屏幕不同
因为3D Touch模块的增加，整个屏幕增厚变重。正是它主要影响了手机尺寸与重量。
结构上，背光模组后增加一层钢片，在背光和钢片之间放置了3D Touch Sensor。实测屏幕模组厚度增加0.73 mm，重量相应增加了20g左右。
另外，TP(触控层)和LCD(液晶屏)由之前的分别同主板连接改为TP和LCD合二为一，并采用一个IC控制。
连接主板由原来的4个BTB(连接器)改为3个BTB，Home键(包括 Touch ID)同3D Touch共用FPC(排线)，屏幕和触控共用FPC ，有效节省了厚度和主板布局面积。
5.前置摄像头
从120万像素升级到500万。
Touch ID
据称这次提高了指纹识别速度。