天津生物工程职业技术学院开设有化学制药系、药学系、医疗器械系等6个系，涉及化学制药技术、生物制药技术、医药外贸、医药管理等18个专业。
根据校官方显示，天津生物工程职业技术学院的重点专业有：全国职业院校健康服务类示范专业点：中药；高等职业教育创新发展行动计划（2015-2018年）认定骨干专业：药品质量与安全、中药学；校级重点专业：生物制药技术、化学制药技术；央财支持重点建设专业：中药制药技术；市级优质特色专业：药物制剂技术、药品经营与管理、中药学；市级优质骨干专业：药品经营与管理、药品质量与安全(药品质量检测)、中药学；市级骨干专业：医学生物技术；市级优质专业：医疗器械维护与管理。