苏州大学机电工程学院拥有多个实力强大的科研团队，致力于推动机电领域的发展。以下是各团队及其主要研究方向：
“机电传动理论与应用”团队（由芮延年担任负责人）重点关注机电传动控制理论的应用，包括创新理论在实际操作中的应用以及吸音隔声和隐身技术的研究。
“激光先进制造”团队（石世宏负责）专攻激光加工成形与表面强化技术，还深入研究激光制造装备的关键部件和涂层零部件的服役性能与材料设计。
“机械设计及理论”团队（冯志华带领）致力于新型纺织机械的研发，同时探索机械动力学、非线性动力学控制以及振动、冲击与噪声的管理。
“控制理论与控制工程”团队（张茂青负责）侧重于生产装备控制软件的开发，远程控制系统的研究，以及磁悬浮控制技术和节能降耗控制技术的创新。
“精密仪器及机械”团队（翁桂荣主管）致力于生物医学图像检测处理技术、设备监测诊断以及超声抛光与噪声分析仪器的研发。
“车辆工程”团队（郭旭红指导）专注于车辆设计理论与制造方法，车辆结构强度分析，以及车辆系统动力学与控制的研究。
最后是“材料成型装备及控制”团队（陈再良领导），他们研究数字化模具设计与制造，数字化工厂设计与仿真，以及橡塑成型工艺和设备技术。
苏州大学机电工程学院是苏州大学建院较早、实力较强的工科学院之一，其前身是始建于1977年的苏州丝绸工学院机电系，1978年、1980年分别设置“纺织机械”、“工业电气自动化”本科专业，1978年开始招收硕士研究生。1997年7月，苏州丝绸工学院并入苏州大学，原苏州丝绸工学院机电系与原苏州大学工学院合并重组成立新的苏州大学工学院。随着办学形势的发展，1999年底，苏州大学工学院划分成机电系、电子系、计算机系等三个独立系，2001年，苏州大学机电系更名为苏州大学机电工程学院。几十年来，为国家培养了大批经济建设急需的高级工程技术人才。