复旦大学的院系有：复旦学院 ，中国语言文学系，历史学系，文物和博物馆系，旅游系 ，哲学学院，经济学系，世界经济系，国际金融系，保险系，公共经济学系，国际政治系，公共行政系，政治学系，法学院，新闻学系，广告学系，广播电视系，传播学系，英语语言文学系，德语语言文学系，俄语语言文学系，翻译系，法语语言文学系，日语语言文学系，朝鲜语（韩语），大学英语教学部，社会发展与公共政策学院，艺术设计系，数学科学学院，物理学系，现代物理研究所，化学系，高分子科学系，环境科学与工程系，生态与进化生物学系，遗传学和遗传工程系，微生物学与微生物工程系，生物化学系，生理学与生物物理学，电子工程系，通信科学与工程系，光科学与工程系，光源与照明工程系，微电子学系，计算机科学技术学院，材料科学系，力学与工程科学系，财务金融系，会计学系，统计学系，产业经济学系，企业管理系，信息管理与信息系，管理科学系，市场营销系，上海医学院，公共卫生学院，药学院，护理学院，软件学院，微电子研究所，国际文化交流学院，复旦大学上海视觉艺术学院。
复旦大学（Fudan University），简称“复旦”，位于中国上海，由中华人民共和国教育部直属，中央直管副部级建制，位列211工程、985工程，入选双一流、“珠峰计划”、“111计划”、“2011计划”、“卓越医生教育培养计划”，为“九校联盟”成员、中国大学校长联谊会成员、东亚研究型大学协会成员、环太平洋大学协会成员、21世纪大学协会成员，是一所综合性研究型的全国重点大学。
复旦大学创建于1905年，原名复旦公学，是中国人自主创办的第一所高等院校，创始人为中国近代知名教育家马相伯，首任校董为国父孙中山。校名“复旦”二字选自《尚书大传·虞夏传》名句“日月光华，旦复旦兮”，意在自强不息，寄托当时中国知识分子自主办学、教育强国的希望。1917年复旦公学改名为私立复旦大学；1937年抗战爆发后，学校内迁重庆北碚，并于1941年改为“国立”；1946年迁回上海江湾原址；1952年全国高等学校院系调整后，复旦大学成为以文理科为基础的综合性大学；1959年成为全国重点大学。2000年，原复旦大学与原上海医科大学合并成新的复旦大学。截至2017年5月，学校占地面积244.99万平方米，建筑面积200.20万平方米。
复旦师生谨记“博学而笃志，切问而近思”的校训，力行“刻苦、严谨、求实、创新”的学风，发扬“爱国奉献、学术独立、海纳百川、追求卓越”的复旦精神，以服务国家为己任，以培养人才为根本，以改革开放为动力，为实现中国梦作出新贡献。
复旦的新闻系是中国历史最悠久的新闻传播专业，开创历史最早，至今仍然是新闻界的泰山北斗。依托复旦强大的综合优势和通识教育，再加上一流的文科基础教育，与人大侧重培养专业水平不同，复旦的新闻学专业更能培养人的综合能力。
汉语言文学
复旦大学文科优势强大，在中国校友会网最新发布的2014中国大学文学学科专业排行榜中复旦全国排名第四。复旦的汉语言文学专业注重通识教育与专业学习，培养的学生综合能力都较强。
物理学
复旦的物理学科全国非常有名，在本科教育中，坚持名教授上基础课和专业主干课。该专业毕业生的优良素质在国内外享有良好的声誉，近几年来每年约有55%的本科生被国内外大学和研究单位录取为研究生。
数学与应用数学
复旦数院，论科研实力，绝对是在全国最顶尖之列，数学与应用数学在全国具有领先地位，复旦的数学在全国来说仅次于北大。能进入复旦数院是一件很了不起的事情，首先说明你很优秀，同时你会发现同学都是来自五湖四海的学霸，你将会与一群极为优秀的同学共同学习四年！数院的发展前景也相当广阔，无论是出国，考研抑或是就业都有着很多很好的先例。数院的转专业考研大军也很具实力，复旦经院、北大光华、人大财大都是大把大把的。事实上，能把数学学好的人，一定不会混的太差。
管理科学
管理学院目前排名全国第三，中国大陆通过AACSB和EQUIS两大全球管理教育顶级认证的商学院只有三家，复旦，清华和中欧。与经院学术风格不同，管院更加注重于实践和soft skill的培养，整体氛围会比较欢脱一些，每个人都会有一对一的教授当导师。管院的交换项目特别多，大概有一半左右的同学有过比较长时间的海外交换经历，这个比例在国内来说是非常非常高的了。总得来说如果你期望有一次国外交换的体验和更实践性质的课程，那么请选择管院。还有管理科学对数学要求很高，要做好心理准备哦~
微电子学
微电子专业排名很好，和清华，北大是微电子领域三驾马车。但实际实力和清华差不多，比北大好。不过跟清华方向有差别。复旦微电子偏向设计，集成电路设计方面都是全国最好的，是国家大规模集成电路项目的主要负责单位。
预防医学
复旦的预防医学在全国的水品还是很高的，而且因为并不是很主流，人数较少，导师和学生之间沟通很多。就业的话，就业率很高，一般来说是预防控制中心最多，还有卫生局、食品药监局等政府部门；还有可以做科研，毒理、营养学什么的都是科研方向。
基础医学
复旦大学上海医学院按照教育部的排名的话，基础医学位列第一。在最新一轮教育部官方学科评估中，复旦大学的基础医学得分88分，排名全国第二，仅次于北大医学部。
化学
复旦理科好的要属数学和化学了，化学尤其突出。在交叉学科很严重的今天，化学学科已经和工程、生物、材料、能源密不可分。所以在复旦这么一所综合实力强的大学里，化学优势就比较明显。
核技术
随着国家的能源建设，国家核工业发展，以及大量的通过核电站方式提供清洁安全能源的需求，国家需要本科生培养。复旦有一个专业叫原子核物理，主要注重研究生培养，所以在实验室、师资等资源配置上具有优势，所以这个专业09年应运而生。