可以。
棚户区改造，涉及的法律程序是“征收拆迁”。依据法律规定，如果征收拆迁的法律程序合法，被拆迁人在法定的期限内，既不提起司法救济程序，又拒绝搬迁的。征收方可以申请人民法院强制执行。
法律依据：国务院令第590号，
第二十八条 被征收人在法定期限内不申请行政复议或者不提起行政诉讼，在补偿决定规定的期限内又不搬迁的，由作出房屋征收决定的市、县级人民政府依法申请人民法院强制执行。
强制执行申请书应当附具补偿金额和专户存储账号、产权调换房屋和周转用房的地点和面积等材料。
"棚户区"一般指简易房屋和棚厦房屋集中区，也即城市中结构简陋，抗灾性差即抗震、防火、防洪性差，居住拥挤，功能差、居住环境差、无道路、无绿化、无公共活动场地、采光通风差的房屋集中的地方。
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