在动漫《火影忍者》中，根组织是一个这么样的存在？
一谈起根组织都会想到戴着动物面具的一群忍者，可是这些忍者并不全是根组织成员，一部分也是归属于火影的暗部，另一部分根组织也是完全有别于暗部的存在。他们的存在对木叶的长治久安给予了确保，那麼根组织是一个这么样的存在呢？
根组织的成立
在第二次忍界大战中，二代火影应对金角银角带领的忍者部队，不能全身而退，为木叶可以留下萌发的绿叶，临终前将火影之名信赖于猿飞日斩。这一托付也真正宣布志村团藏火影之争的落榜，只有处于被动挑选协助三代火影。
但二代火影一直没能解决好宇智波一族的分歧，只有随处防备宇智波一族。伴随着二代火影离开，三代火影没法担负抵制宇智波一族的重担。因而，默认设置了根组织的成立，以志村团藏为头领，担负起了木叶的“黑暗”。
根组织的使命
根组织成员没有性命，没有自由，一切以服从命令为天职，只屈服于团藏一人。创建之初便是为了抑止宇智波一族，与此同时在黑暗中监控以维护木叶，但志村团藏的欲望不止于此，曾以十人小组刺杀三代火影，最终以卡卡西的倒戈每日任务不成功。
另一方面，宇智波一族合谋谋反，团藏直言进谏，指令宇智波鼬消灭全族，平复了叛变。三代火影观念到了根组织过度偏激的处理方式，一声令下解散根组织，与此同时消除了团藏火影协助一职。但根组织并没有完全消退，反而是躲进了木叶的更最深处，以伺机会。
根组织成员
根组织从成立到名义上解散，塑造出了诸多的菁英忍者，卡卡西、鼬、大和、信、油女取根、佐井全是这其中的佼佼者，他们为木叶作出了很大的贡献，特别是在卡卡西、大和还为木叶塑造出了强力的下一代。与此同时也成为了那时候木叶的栋梁，这些优秀人才得输出可谓是根组织为木叶作出的最大的贡献。
根组织的最终解散
伴随着佩恩攻击木叶未遂，五代火影不省人事，团藏执政木叶的时期到来。各大国因为见到晓组织恐怖的力量，召开大国会议以联合抵抗晓组织。带土借机启动第四次忍界大战，佐助为兄报仇，杀掉团藏，一时间根组织群龙无首。另一方面，第四次忍界大战以鸣人成长战胜结束，忍者世界迈入了阔别多年的友谊，应各大国提议，木叶根组织完全解散。