怪盗基德知道柯南是新一。
在《名侦探柯南世纪末的魔术师》里怪盗基德解开复活节之蛋的迷之后，在火中救出了柯南，在解迷过程中通过观察知道了柯南就是工藤新一，最后在柯南要吐露真相时，假扮成工藤新一帮柯南掩饰了真相。
人物介绍：
怪盗基德是驰骋于世界各地，神出鬼没的大怪盗。技术一流，高超的易容术连柯南都能骗过。在柯南中，怪盗并不仅仅是传统意义上的小偷，也不同于行侠仗义的义贼，犯案之前经常狂妄的发送犯罪预告函，即使这样也能在众目睽睽之下将宝石或美术品等目标盗走，是柯南最大的劲敌，虽然识破了柯南的真实身份，但没有声张。基德不是纯粹的窃贼，基德四处窃取宝石是为了查明与父亲有关事件的真相。
在《名侦探柯南世纪末的魔术师》里，怪盗基德化装成白鸟警官，并且偷来了复活节之蛋，怪盗基德解开复活节之蛋的迷之后，在火中救出了柯南，在解迷过程中通过观察知道了柯南就是工藤新一，当结尾毛利兰怀疑柯南身份的时候，怪盗基德化身工藤新一帮助他解围，瞒过了小兰。这一事件其实就是交代了他知道柯南的身份就是工藤新一，并且他还知道这个侦探为了某个原因有意隐瞒自己的身份。
另外在第76集里柯南虽是第一次见到基德，而基德已经感觉到柯南似乎就是从前那个给他添麻烦的侦探，所以要说基德知道柯南身份最早是就在第76集，但具体说明如何知道的就是在第219集里《新一VS怪盗基德》里，介绍了基德与在变小之前的新一的一次较量。据传怪盗基德本是个家境富足，衣食无忧的公子哥，只不过厌倦了这种衣来伸手的生活。所以才一次次的当小偷，只为了找寻刺激，也为了证明自己。对于柯南这种头脑异常聪明的神童，基德不可能没有兴趣，不过要调查一个人的信息，对于他来说并不困难，即便是找别人帮忙，也是能够轻易办到的。所以他的人脉应该还是很广的，想要调查一个人的身份应该不是什么难事。而且他能够轻松地探听对方的电话，这也足够使他调查出柯南的身份。
《名侦探柯南世纪末的魔术师》剧情介绍：
罗曼诺夫王朝的皇室秘宝－回忆彩蛋，将在大阪铃木财团美术馆内展出的同时，怪盗基德寄出“犯案预告信”准备夺取这无价的皇家艺术之宝，于是铃木会长要求小五郎协助警方侦查，以防彩蛋被窃取。柯南一行人来到大阪，遇到服部平次，便一同侦查此案。在美术馆遇到了大使馆的、珠宝美术商、罗曼诺夫王朝研究家、职业摄影师等人。看完彩蛋，大家便解读预告信线索，不料将时间、地点都解读错误。而基德窃听到彩蛋被转移了。
在疏於防备的情况下，基德成功地找到了回忆彩蛋。虽然柯南已经发现了基德的行动，看还是晚了一步。基德在逃离途中，却被神秘的杀手狙击，坠海失踪，生死不明。柯南以新型滑板追踪，夺回彩蛋。与此同时从国外回来的香阪夏美小姐，从祖母的遗物中发现彩蛋的原稿图与实物不同。柯南看了原稿后，认为彩蛋有两颗，而在彩蛋的玻璃上映照出夏美曾祖父所盖的城堡，所以大家，包括对彩蛋虎视眈眈的研究者决议要去此城探索，找寻第二颗彩蛋。在返回东京的船上，摄影师寒川被杀，而且和基德相同是被击中右眼。目暮带着白鸟赶到，调查后柯南发现凶手可能是职业杀手史考兵。而白鸟却几次揭穿柯南的提示，使小兰对柯南的身份起了怀疑。
到达东京后，大家前往城堡，阿笠博士为了送做给柯南强化的眼镜，与灰原哀也一同出发至城堡，不料少年侦探团也藏身在车上跟踪而行。在城堡中，柯南意外发现通往地下室的通道，在秘道中珠宝商乾被杀。而其他人在一个棺木中发现了第二个蛋，并明白了回忆之卵的真正含义。但专门狙击人右眼的神秘杀手“史考兵”也在人群之中。他再次行动，目标是小五郎和小兰，刺杀失败后凶手抢走了彩蛋，并想烧毁城堡。柯南追赶凶手，在熊熊大火中，凶手露出了她的真面目。柯南在白鸟的帮助下逃出了火海。回家后小兰对柯南的真实身份再次起了疑问，正当柯南要说出真相时，新一出现了。
《名侦探柯南：世纪末的魔术师》是日本东宝公司于1999年4月17日出品的一部动画电影。该片是《名侦探柯南剧场版》的第三部。由儿玉兼嗣执导。高山南、山崎和佳奈、神谷明等人担任主要配音。
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