1986年6月，国务院批准曲阜县撤县设市，曲阜市纳入济宁市代管范围，标志着行政区划的重要调整（经国务院批准，撤销曲阜县，设立曲阜市，由济宁市代管）。
2000年12月1日，行政区域进行了进一步的整合，鲁城街道和书院街道分别由原曲阜镇和书院镇设立，尼山乡并入南辛镇，这一系列举措提升了行政管理的效率（撤销曲阜镇和书院镇，分别设立鲁城街道和书院街道办事处，尼山乡并入南辛镇）。
截至2011年9月，曲阜市行政区划划分为4个街道和8个镇，涵盖了41个居委会、355个村委会以及483个自然村，总面积达到896平方千米。特别是董庄乡更名为石门山镇，对提升石门山景区知名度和推动旅游休闲产业发展起到了积极的作用（董庄乡改为石门山镇，旨在提升景区知名度和推动旅游产业发展），标志着城镇化进程的显著提升。
人口方面，曲阜总人口为64万人，其中孔姓人口占比约1/5，约15万人，显示出深厚的文化底蕴（曲阜总人口64万，孔姓人口占15万，体现独特的人文特色）。
当时的领导阵容包括市委书记、市人大常委会主任李长胜和市委副书记、市长杨凤东，他们共同推动着曲阜市的行政管理和经济发展（由市委书记李长胜和市长杨凤东共同领导）。
[1]曲阜市，位于山东省西南部，古称鲁县，是周朝时期鲁国国都。“曲阜”之名最早见于《礼记》，曲阜东汉应劭解释道：“鲁城中有阜，委曲长七、八里，故名曲阜”。曲阜是我国古代伟大的思想家、教育家、儒家学派创始人孔子的故乡。1982年被国务院公布为首批历史文化名城，被西方人士誉为“东方耶路撒冷”，也是世界四大圣城之一。