民办非企业单位和企业单位的区别有：
1、定义不一样：企业单位一般是指生产性单位。民办非企业单位是企业事业单位、社会团体和其他社会力量以及公民个人利用非国有资产举办的，从事非营利性社会服务活动的社会组织。
2、特点不一样：企业单位的特点是自收自支，通过成本核算，进行盈亏配比，通过自身的盈利解决自身的人员供养，社会服务，创造财富价值。民办非企业单位的特点是不以营利为目的。
3、领域不一样：民办非企业单位的主流分布在教育事业、卫生事业、文化事业、科技事业、体育事业、劳动事业、民政事业、社会中介服务业和法律服务业。企业单位则涉及到社会的各行业中，大部分领域都有企业单位的涉足。
参考资料：
(1)民办非企业单位，是指企业事业单位、社会团体和其他社会力量以及公民个人利用非国有资产举办的，从事非营利性社会服务活动的社会组织.
(2)企业是从事生产、流通、服务等经济活动，以生产或服务满足社会需要，实行自主经营、独立核算、依法设立的一种盈利性的经济组织。
(3)民办非企业单位是个新概念。它是于1996年中央和国务院领导针对以往的民办事业单位这一概念所作出的修正。即:事业单位是国家举办的，而民间不应再称事业单位。1998年10月，国务院颁布了《民办非企业单位登记管理暂行条例》，将民办非企业单位界定为:企业事业单位、社会团体和其他社会力量以及公民个人利用非国有资产举办的，从事非营利性社会服务活动的社会组织。
(4)企业单位一般是自负盈亏的生产性单位。
(5)事业单位一般是由国家设置的，带有一定公益性质的机构，但不属于政府机构，其人员与公务员性质也是不同的。目前，我国的事业单位大体可以分为"全额拨款"、"参公(即参照公务员)"、"财政补贴"、"自收自支"四类。
(6) 民办非企业单位是民间通过工商行政管理机关登记成立的不以盈利为目的组织，内容比较广泛，如互助基金会，协会等等
(7)企事业单位是企业单位和事业单位的总称．
企业：是指以盈利为目的，从事生产经营活动，在工商部门申请注册登记，办有营业执照的个人独资企、合伙企业、国有企业、集体企业、公司、外商独资企业、中外合资企业、中外合作企业等各类内资、外资、私营企业的通称．企业一般自主经营自负盈亏