滤镜表面的污斑通常是由
灰尘、指纹、水渍等污物附在滤镜形成的，清洁起来不用像清洁镜头镜片那样有有太多的讲究。但清洁时应遵守先吹后刷的原则，对于顽固污渍可使用专用的湿镜头纸擦拭，无论是用镜头刷、镜头笔还是镜头纸擦拭镜头，都应以画圈的手法由镜片中心向外逐渐扩大。
清洁步骤：
1.用吹气球吹：首先用吹气球（也叫洗耳球）吹净镜头表面的浮尘、极微细的灰尘。不要直接用嘴去吹，那样的话会有很多的唾液微粒吹到镜片表面，那样就更难处理了。
2.用擦镜布/镜头纸轻轻擦拭：如果用吹气球无法清洁掉镜片表面的灰尘，我们还可以尝试使用软刷清洁镜片，一般的话就可以去除灰尘等脏东西，而对于顽固一些的污渍，例如指痕等，我们就要使用
麂皮、镜头清洗布或镜头纸配合镜头清洗液来进行清洁了。在擦洗时，注意不要用力挤压镜片表面，因为大部分滤镜镜片表面覆盖有一层易受损的涂层，很容易因为用力清洁而被擦去。将筒状的毛端由镜头的中央旋转向外，轻轻的扫，这样就去能除镜头上的杂质了。在购买镜头纸时，一定要到正规的专业摄影商店去买，千万不要贪图便宜而购买劣质的镜头纸。
3.用镜头笔轻擦：使用镜头笔前务必保证吹净镜片表面，确保没有任何灰尘颗粒，再竖直轻压镜头笔从镜片中间
顺时针向外赶，一次后注意吹去镜头表面脱落的镜头碳粉，再观察效果，再擦再吹！反复4-5次镜头就应该光亮如新啦！行家说过任何擦镜头的行为都是伤害镜头镀膜的！镜头笔虽是比较安全的工具，您也要小心使用，用镜头笔轻擦，应该注意的是，镜头笔也是有寿命的，当刷毛磨平之后，就必须更换。对镜头永远要多吹少擦！
4.用镜头清洗液去除顽固污渍：对于滤镜来说则无需顾忌这么多，大部分玻璃滤镜直接水洗都没有关系。而对于镜头镜片请慎用！关于是否采用镜头清洗液清洁镜头的争论很多，有些劣质的杂牌清洗液也确实会对镜头造成损伤，所以我们建议如果单纯使用麂皮等工具可以清洗掉镜头上的顽固污渍，那么就可以不必使用清洗液，万不得已使用时也一定要注意使用的量不宜过多，而且不要把清洗液沾到镜头之外的地方，因为有的清洗液的成分是
丙酮，很容易使黑色的镜头边缘掉色，严重的还会使镜头周围变形，切记切记！镜头有油污或指纹，吹、刷都无效，就要用极柔软的洁净棉签儿（或揩镜纸）沾上一点镜头水轻轻擦拭。不推荐使用镜头清洁液，清洁液经常使用，会洗去镀膜。另一方面，清洁液在晾干时不可避免的还会再沾上污物。
对于感光元件前面的低通滤镜通常自己只能采用气吹清洁，使用果冻笔清洁起来较麻烦，也不太好掌握。对于顽固污渍建议送维修中心清洁。
使用果冻笔清洁步骤和注意事项如下：
1、清洁前后不要开
电风扇，尽可能在无飞尘的环境中操作
2、设定相机光圈f/22，对着白纸或天空先拍几张照片，并记住污点的位置；在相机电源关闭的情况下将镜头卸出，然后再打开相机电源，按一下相机背部“LV”按键，相机的反光板便提升并可以看到传感器了（部分尼康相机菜单里有“向上锁定反光板以便清洁”选项，打开后按下快门键即可，清洁完成后直接关闭相机电源即可，注意该选项在相机电池电量低于80%后无法打开）。
3、最好带一下口罩，因为在清洁CCD/CMOS时脸部会很靠近相机，呼吸有时也会把一些小灰尘也吹进去。
4、果冻笔要先在除尘纸上清洁干净，并且果冻笔不要碰到任何东西，除了CCD/CMOS。
5、每清理一个污点后要将清洁头在所附的除尘纸（可用透明胶带代替）上压一压，压过的地方就不要重复使用（记得不要不经过除尘纸清洁就重复粘低通滤镜，不要用力过度，否则灰尘绝对有可能由浮尘变成被牢牢压在低通滤镜上，这样清洁头本身的粘性就不足以再把它粘下来了。
6、最好是有污点的地方才清理，不要整片CCD/CMOS都清（污点的位置是拍出来的照片和看CCD/CMOS的方向上下颠倒的地方）
7、果冻笔头用过几次之后会不太粘，可以自来水洗一洗，再甩干它，千万不要用任何东西擦干，会有毛屑粘在上面 。
8、装上镜头再重复2的步骤，看看是否清理干净。
9、清洁果冻笔，收好注意避光避高温避潮湿保存。