136 黑暗组织来的女子 大学教授杀人事件（一）
137 黑暗组织来的女子 大学教授杀人事件（二）
138 黑暗组织来的女子 大学教授杀人事件（三）
139 黑暗组织来的女子 大学教授杀人事件（四）190 与黑暗组织再次重逢 灰原篇
191 与黑暗组织再次重逢 柯南篇
192 与黑暗组织再次重逢 解决篇249 神秘乘客 上集336 接触黑色组织 决死篇371 与黑衣组织面对面对决 满月之夜的双重事件（一）
372 与黑衣组织面对面对决 满月之夜的双重事件（二）
373 与黑衣组织面对面对决 满月之夜的双重事件（三）
374 与黑衣组织面对面对决 满月之夜的双重事件（四）
375 与黑衣组织面对面对决 满月之夜的双重事件（五）
459 黑色冲击！组织之魔爪触碰的瞬间（一）
460 黑色冲击！组织之魔爪触碰的瞬间（二）
461 黑色冲击！组织之魔爪触碰的瞬间（三）
462 黑色冲击！组织之魔爪触碰的瞬间（四）
463 黑色冲击！组织之魔爪触碰的瞬间（五）
548 红与黑的碰撞 嫌疑 → 501
549 红与黑的碰撞 洁白 → 502
551 红与黑的碰撞 殉职 → 504
最新一次同集出场是701-704的特快列车部分，但是国语版还没更新到那里
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