公章还是应当由法人代表掌控。你们订立公章使用协议也好，作为公司管理制度也好，对你们之间是有效的。但对外可能构成表见代理，法人还是要对外承担责任的，作为法人代表的你还是脱不了干系的。 法人章，实际就是公司法人的个人私章，但必须经过备案，也只有法人企业才有，也就是大家常说的法人个人印鉴，特点是个人性，他一般都保管在公司的财务手中，对外具有一定的法律。 而公司的公章，一般是指公司的在工商部门登记备案企业全称的圆形印章，也就是常说的行政公章，特点是集体性，是对外使用的凭证之一，代表着公司的行为。法人章与公司的公章既有联系，也有区别，两个有时是不能进行代替的。简单的说：公章是代表公司的行为，法人章是与个人相关的个人行为。
《国务院关于国家行政机关和企业事业单位社会团体印章管理的规定》第二十二条 国家行政机关和企业事业单位、社会团体的其他专用印章（包括经济合同章、财务专用章等），在名称、式样上应与单位正式印章有所区别，经本单位领导批准后可以刻制。 《国务院关于国家行政机关和企业事业单位社会团体印章管理的规定》第二十三条 印章制发机关应规范和加强印章制发的管理，严格办理程序和审批手续。国家行政机关和企业事业单位、社会团体刻制印章，应到当地公安机关指定的刻章单位刻制。