蚌埠医学院开设了卫生检验与检疫技术专业，专业代码为630410。这一专科专业是基于学院历史悠久的医学检验专业（安徽省首批省级教学改革示范专业）进行设立的，拥有超过二十年的办学经验和丰富的教育资源。学院根据市场需求和自身条件，为卫生检验与检疫技术专业的创办提供了坚实的基础。
专业培养目标旨在培养德、智、体、美全面发展的专业人才，他们具备卫生检验技术所需的基本知识、理论和技能。毕业生能在各级疾病控制中心、卫生防疫站、环保监测站、卫生检疫局及食品卫生监督检验所等单位从事检测、质检和质量控制工作，具备较强的动手能力和实践性。
学制与学历方面，该专业为卫生检验与检疫技术专科，学制三年，顺利完成学业后将授予卫生检验与检疫技术专科学历。
主干学科包括基础医学和卫生检验技术，主要课程涵盖基础化学、分析化学、微生物学、流行病学、生物化学检验、卫生微生物学检验、免疫学检验、寄生虫学检验、水质理化检验、食品理化检验、空气理化检验、检验检疫学、英语以及计算机基础等。
学院注重实践教学，卫生检验与检疫技术专业的学生主要在疾病预防控制中心、卫生监督所等单位进行实习。学校已与多家机构建立了稳定的实习基地，确保学生在毕业实习期间能够得到充分的实践经验。
蚌埠医学院，创建于1958年7月，由上海第二医学院和安徽医学院援建而成，是安徽省省属普通高等医学本科院校和国家首批具有学士和硕士学位授予权的单位。1968年8月，经安徽省革委会批准改称蚌埠反修医学院；1970年11月，安徽省革委会决定将安徽四所高等医学院校合并为安徽医学院，蚌埠反修医学院更名为安徽医学院蚌埠分院；1974年6月，国务院科教组发文通知恢复蚌埠医学院。