在1999年6月20日，国务院通过决议（国函[1999]51号），撤销达川地区及县级达川市，设立新的地级行政区达州市。市政府的新址设在通川区的荷叶街，这个区的建立包括了原达川市的全部区域，以及达县的双龙乡，但双龙乡的具体划归时间可能需要进一步查询。
1997年的达川市，面积为404.1平方千米，人口总数为34.9万，由2个街道、5个镇和4个乡组成，市政府设在荷叶街。随着行政区划的变化，1999年通川区的构成有所调整，分为2个街道（东城、西城）、5个镇（西外、北外、罗江、蒲家、复兴）和5个乡（包括从达县划入的双龙乡，但具体变更时间未提及），共计12个行政单位。
到了2000年的人口普查数据中，通川区总人口为384,525人，其中包括东城街道83,414人、西城街道77,948人等具体数字。区内有多种民族分布，如彝族、藏族等，展现了多元的文化特色。
到了2009年，通川区的行政区划进一步明确，包括3个街道（东城、西城、朝阳）、7个镇（西外、北外、罗江等）和3个乡（新村、盘石、东岳），区政府驻地设在西外镇，反映出城市发展的稳健和行政管理的精细化。
四川达州市通川区位于（县级）四川东北部，是达州市政治、经济、文化中心，全区辖10个乡镇和三个街道办事处。幅员444.5平方公里，人口40.83万人。