法律分析：商业40年土地使用权是否会被国家收回需要分情况来看：
1、如果国家没有其他的规划，房屋业主再重新缴土地出让金，相当于续租，土地使用权不会被国家收回；
2、建设用地使用权期间届满前，因公共利益需要提前收回该土地的，应当依照相关规定对该土地上的房屋及其他不动产给予补偿，并退还相应的出让金，土地使用权会被收回。
法律依据：《中华人民共和国城市房地产管理法》
第二十条 国家对土地使用者依法取得的土地使用权，在出让合同约定的使用年限届满前不收回；在特殊情况下，根据社会公共利益的需要，可以依照法律程序提前收回，并根据土地使用者使用土地的实际年限和开发土地的实际情况给予相应的补偿。
第二十二条 土地使用权出让合同约定的使用年限届满，土地使用者需要继续使用土地的，应当至迟于届满前一年申请续期，除根据社会公共利益需要收回该幅土地的，应当予以批准。经批准准予续期的，应当重新签订土地使用权出让合同，依照规定支付土地使用权出让金。 土地使用权出让合同约定的使用年限届满，土地使用者未申请续期或者虽申请续期但依照前款规定未获批准的，土地使用权由国家无偿收回。