一、企业所得税。法人股东将持有的其他公司股份转让出去发生利益所得，需要并入企业应纳税所得额计算缴纳企业所得税。并且《国家税务总局关于贯彻落实企业所得税法若干税收问题的通知》(国税函〔2010〕79号)规定，企业在计算股权转让所得时，不得扣除被投资企业未分配利润等股东留存收益中按该项股权所可能分配的金额。所以，计算转让所得时不能扣除应归属于上述公司被投资企业的未分配利润。即即便是股权转让所得中包含税后利润，也不能确认企业所得税免税收入。当然如果在股权转让之前先分配，符合条件的权益性投资收益属于企业所得税免税收入。
二、个人所得税。自然人股东将持有的股权转让所实现的利得按照“财产转让所得”20%计算缴纳个人所得税。个人的应纳税所得额是转让股权的收入总额减去股权的原值和合理费用后的剩余金额。在股权转让交易中，转让方为纳税义务人，_受让股权的一方是扣缴义务_，履行代扣代缴税款的义务。
三、印花税。非上市公司发生的股权转让是按照“产权转移数据”缴纳印花税，税率为价款的万分之五，并且是合同签订的双方均为印花税纳税义务人。纳税义务人为小规模纳税或小型微利企业，可以享受减半征收印花税优惠政策。
四、以股权转让名义转让土地会涉及土地增值税。
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