全日制大专和自考本科两个学历都可以查询到，专科学历不会被本科学历覆盖。
《高等学校学生学籍学历电子注册办法》第十七条规定，学历注册信息应与学历证书内容保持一致。学历注册信息包括：姓名、性别、出生日期、照片；学习起止年月；专业、层次、学制、毕（结）业、学习形式；学校名称、校（院）长姓名及证书编号。
根据上述条款规定，学信网上登记的信息包括专业、层次、学制、学校名称等信息，而全日制大专和自考本科学制、层次都不一致，因此，全日制大专和自考本科两个学历都可以查询到，专科学历不会被本科学历覆盖。
扩展资料：
《高等学校学生学籍学历电子注册办法》
第二十条 就业指导中心依据复核备案的学籍学历电子注册信息，建立全国高等教育学生学籍学历电子注册数据库，为学生和社会提供查询、验证和认证服务。
第二十一条 学生可免费查询本人身份信息、学籍注册信息、学年注册信息和学历注册信息，也可查询本人学籍档案。社会其他部门及个人可依据学生提供的相关信息对学生身份信息、学籍注册信息、学年注册信息、学历注册信息和学生学籍档案进行查询、验证。
第二十二条 依据全国高等教育学生学籍学历电子注册数据库及相关证明材料，就业指导中心可提供认证服务，对申请人申请认证的学历证书或学籍材料的真实性、合法性、有效性进行认定。认证服务以申请人自愿原则进行。
参考资料来源：学信网官网-高等学校学生学籍学历电子注册办法
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