燕山期锡矿主要分布于滨西太平洋成矿域和特提斯-喜马拉雅成矿域东缘（表6-3），其成矿作用以华南造山系为中心向北逐渐减弱，其锡矿储量约占全国锡矿总量的70.5%，分布地区有华南造山系、内蒙古-大兴安岭造山系东部、扬子地台南缘、三江造山系、东南沿海造山系西南部、松潘-甘孜造山系西部、秦岭造山系西部、中朝地台东北缘。
表6-3 中国燕山期锡矿各成矿区储量
其中华南造山系锡矿储量约占全国燕山期锡矿储量的83.6%。燕山早期锡矿床主要分布于华南造山系中部，包括广西东部、湖南南部、江西南部、广东北部。广西东部以恭城栗木矿区为代表，矿床为大型蚀变花岗岩型；江西南部以大余漂塘、会昌岩背锡矿床为代表，前者为石英脉型锡矿床，后者为斑岩型锡矿床；湖南南部以郴州柿竹园大型硫化物夕卡岩-云英岩型锡矿床为代表；广东北部以连平大顶大型磁铁夕卡岩型锡铁矿床为代表。
燕山晚期锡矿床主要分布于华南造山系四周，包括广西北部、云南东部、广东南部等地区。广西北部地区以南丹大厂锡矿为代表，矿床为超大型硫化物脉型锡矿床；云南东部地区以个旧、马关都龙锡矿为代表，个旧锡矿为超大型硫化物夕卡岩型锡矿床，马关都龙锡矿为大型硫化物脉型锡矿床。广东南部地区以信宜银岩锡矿为代表，矿床为大型斑岩型锡矿床。
燕山期内蒙古-大兴安岭锡矿带其储量占全国燕山期原生锡矿储量的8.2%，分布于该区东部地区，锡矿床形成于燕山早期，以克什克腾旗黄岗夕卡岩型铁锡矿床为代表。
燕山期扬子地台原生锡矿储量约占全国燕山期原生锡矿储量的1.6%。燕山早期锡矿床分布于扬子地台东南部（浙江西部地区），代表性矿床有淳安县白沙畈锡矿和泰顺县洋滨锡矿，白沙畈锡矿为小型磁铁夕卡岩型锡矿床，洋滨锡矿为斑岩型锡矿床，矿床为小型。燕山晚期锡矿床分布于扬子地台南部（江西北部），代表性矿床有德安曾家垅锡矿和尖峰坡锡矿，两矿床均为中型硫化物夕卡岩型锡矿床。
三江造山系燕山期原生锡矿分西亚带（腾冲地区）和中亚带，储量占全国燕山期锡矿储量的3.9%。西亚带中代表性矿床为云南腾冲小龙河云英岩型锡矿床与来利山云英岩型和锡石硫化物型矿床，前者为中型，后者为大型；腾冲老平山锡矿床为中型石英脉型锡矿床。
中亚带中代表性矿床为铁厂和薅坝地中型电气石脉型的锡矿床。
东南沿海燕山期原生锡矿分布于该区西南部，储量占全国燕山期锡矿储量的1.3%，代表性矿床有广东潮州厚婆坳锡石硫化物脉型锡、铅、锌矿床，矿床为中型。
松潘-甘孜造山系燕山期原生锡矿，分布于该区西部与三江造山系过渡带，锡矿储量占燕山期锡矿储量的0.9%，代表性矿床有四川德格硐申达锡矿、石渠射基岭锡矿和巴塘荼洛锡矿，均为中型夕卡岩型锡矿床。
秦岭造山系燕山期锡矿分布于该区西部与昆仑造山系过渡带，储量占燕山期锡矿储量的0.4%。代表性矿床为青海日龙沟硫化物夕卡岩型锡多金属矿床，矿床为中型。
中朝地台燕山期锡矿分布于该区东北部与内蒙古-大兴安岭造山系过渡带，锡储量仅占燕山期锡矿储量的0.1%，有辽宁本溪套岫铜矿等，矿床为小型。