大家都知道，朱元璋出生贫寒，最惨的时候甚至四处乞讨，之所以能一飞冲天，便是因为加入红巾军，而红巾军则是明教和白莲教的结合体，正是借助这些力量，朱元璋才在乱世脱颖而出，成为一代帝王，然而也正是因为知道这些宗教力量，在明教建立后，无论是明教还是白莲教，都被打上邪教标签，被朱元璋极力镇压，可以说是被朱元璋给压制了，因为朱元璋本就是借助了这些力量才能最终登位成功，在朱元璋上位的时候，他对于这些势力非常重视，由于打压得极为彻底，白莲教也始终在明朝先不起掀起太大的波浪。
在朱元璋看来，他明白这些邪恶组织一旦发展起来会给自己带来多么大的麻烦，因此朱元璋知道必须要将他们扼杀在摇篮里。当然这些教派自身也存在许多原因。
明朝建立后，朱元璋对白莲教和明教极力打压，虽然白莲教依然存在，但基本转向地下活动，虽然明朝很多暴动都与白莲教有关，随着时间的推移，白莲教的大部分领导人们也知道，想要在太平盛世一呼百应，根本不可能，于是目标悄悄的变了，不再是推翻朱家的天下，而是借着白莲教的名义，大肆敛财，中饱私囊。
明清时期，白莲教的教义发生变化，很多领导者都变成了女性，比如唐赛儿、王聪儿，这些女领袖在起事初期，确实能带来一些震撼，但在封建社会，女性社会地位普遍低下，想要通过她们的领导推翻封建王朝，根本不可能，小打小闹而已，先要形成一股强大的势力，难上加难，等待她们的，只有被朝廷大军围剿的命运！
元朝末年，白莲教和明朝之所以能兴盛，将蒙元赶出华夏大地，一是因为当时的社会背景，而是因为白莲教和明教在当时只是民间组织，统治者并不知道他有多达的能力，而明朝的开国皇帝朱元璋，自己本身就是出自明教，甚至在早期为了宣扬自己的正统，还说自己是明王降世，白莲教和明教有多达的力量，朱元璋心知肚明，因此在明教建立后，明朝历代统治者都极力打压白莲教和明教，根本不给他们机会形成庞大的势力，在明朝统治者严密的监控下，白莲教根本没有做大的机会，这也是白莲教在明朝无法壮大的根本原因。