南京医科大学附属口腔医院坐落在风景优美的五台山南麓，医院占地总面积18000平方米，主楼高达15层。目前，医院拥有约400名工作人员，其中高级专业技术人员近60人，包括了全省70%的口腔医学博士。医院的专家阵容强大，有20多位专家担任中华医学会、中华口腔医学会等重要学术组织的常务理事或委员，甚至有1人获得国务院政府特殊津贴。此外，医院还拥有多名博士生导师、硕士生导师，以及多名在江苏省享有特殊荣誉的医学专家，如“有突出贡献的中青年专家”、“333工程”培养人才等。
作为江苏省口腔医学领域“十一五”重点学科，医院具备口腔临床医学博士和口腔医学一级学科硕士学位授予权，是江苏省培养口腔医学博士的主要基地，培养了江苏省80%以上高学历口腔医师。医院设有先进的口腔医学研究所，拥有前沿科研设备，承担多项国家级口腔医学科研项目，屡获省级和国家级科技成果奖，尤其在口腔医学新技术引进方面成绩斐然。医院在“十五”期间，医疗新技术引进奖项占全省口腔专业类的54%，科技进步奖占80%，其中包括江苏省口腔医学界最高荣誉奖项。
医院科室全面，技术力量强大，设有牙体牙髓黏膜科、牙周科等11个一级临床科室，以及3个二级科室和5个辅助科室。口腔内科、修复科、正畸科和颌面外科等被列为江苏省临床重点专科，其中正畸科还是“科教兴卫工程”重点学科和建设学科。医院配备88张病床和200台口腔综合治疗台，年门诊量超过30万人次。在消毒管理上，医院是江苏省首批实行口腔手机“一人一用一灭菌”规范的医疗机构，还创新提出“诊前3分钟”医疗服务理念，受到卫生部的认可。
医院积极推动国际交流，已与美国、德国等国家和地区建立了学术合作关系，定期派出学者交流学习，并接纳海外进修生。医院也定期举办国际口腔医学学术会议，开展多项国际合作项目，致力于提升国际影响力。
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