顺序为：《百步飞剑》→《夜尽天明》→《诸子百家》→《万里长城》→《君临天下》→《沧海横流》2017年11月30日，官方在《秦时明月之君临天下》第75集大结局中确定了《沧海横流》为结局篇。
1、第一部：秦时明月之百步飞剑（2007年）
剧情简介：天下第一剑客盖聂，带着已故挚友的儿子荆天明，一路颠沛流离，只为了躲避秦王的追杀。在以一人之力击退了秦王派出的三百骑兵之后，荆天明在盖聂的身上看到了真正的侠肝义胆。此事传到宫墙之内，秦王大怒，命令宰相李斯一定要将他们两人除之而后快；
于是，李斯找到了盖聂曾经的同门师兄手下败将卫庄，想借他之手，完成自己的使命。 卫庄派出了手下四大天魔王一路袭击盖聂，而盖聂和荆天明则获得了少羽、高月和墨家众人的鼎力相助，屡屡死里逃生。最终，卫庄将盖聂一行人逼至绝境，只为了能够再同他比试一场。
2、第二部：秦时明月之夜尽天明（2008年）
剧情简介：故事取材于秦始皇灭六国到西楚霸王项羽攻陷咸阳这一英雄辈出的历史时期，此后数年间，各种历史传说纷呈迭起，诸子百家也伴随着历史风云横空出世，筑就了一部气势恢宏的故国群英图。少年荆天明如旷野杂草顽强地生长在时代变革的乱世之秋，剑客高渐离、盖聂，隐士墨家及众多豪杰仰天长啸于古华夏天宇。秦始皇、项羽，这些纵横捭阖的旷世英雄和历史人物在一出场时，就给了观众更具时代感的张力表现和视觉冲击。
3、第三部：秦时明月之诸子百家（2010年）
剧情简介：故事发生在二千多年前的战国时期，秦始皇统一六国损兵达百万计，项燕兵败阵亡，少羽被困，高渐离、雪女、大铁锤赶来相救。兵败后，盖聂、墨家、项氏一族踏上逃亡之路。李斯进入儒家后，拜访先师荀子，荀子避而不见。
同入儒家的少羽尊从法理少年老成，端木蓉由于被白凤所伤终日不醒，张良授计让天明与其对弈救木蓉。星魂对清秀的月儿产生浓厚兴趣反遭冷眼警告，月神把月儿带到东皇太一面前，东皇向她公布了自已的真实身世。少羽与天明观海时得知秦始皇要登临东海尽头的那座城市，暮色归途中又遇见流泪的石兰，交谈中少羽知道杀父仇人蒙恬来了，他该怎么办...
4、第四部：秦时明月之万里长城（2012年）
剧情简介：《秦时明月》的背景取自秦始皇统一六国到西楚霸王项羽攻陷咸阳时期，已被翻译成7国语言，发行至全球37个国家及地区。 《万里长城》是《秦时明月》的第四部。自从机关城崩塌，墨家势力几乎全部清除。秦帝国又回到太平盛世迷梦中。咸阳宫中的始皇一边动用无数劳工修造万里长城，一边进行着更为精密的计划。
现在这个计划已经接近完成，由阴阳家协助完成的巨艇“蜃楼”已经建造完毕。它壮丽精绝的身姿浮现海平面彼端，宛如人人梦想中的 海上仙山。为了解开巨艇“蜃楼”的疑团，各家各派势力慢慢汇聚到这座平静的海边小城。此时，故事主角天明和少羽为了避开秦兵追捕，正在儒家庄园学习和生活。而接下来各种奇异事件在此地发生，小城的平静也被完全打破。
5、第五部：秦时明月之君临天下（2014年）
剧情简介：为躲避公输家族霸道机关兽的追杀，天明、少羽、石兰三人误打误撞，登上了停泊在海边的蜃楼。这艘始终停留在远处，可望而不可即的神秘巨舰，终于第一次近距离展现在三人面前，它华丽的外表之下，隐藏着天大的秘密。
为躲开蜃楼上阴阳家弟子的追捕，三人逐渐深入到这座谜城一般的巨舰内部，开始了奇幻莫测的探险逃亡之旅。与此同时，庖丁顺利从秦军监狱脱逃，并为墨家众人带回了重要信息，张良连夜制定出了第一步行动计划，青龙计划由此缓缓拉开序幕。
6、第六部：秦时明月之沧海横流（2018年）
剧情简介：又一场狂风骤雨随着日出东方悄然逝去，粉碎了反秦联盟的刺杀行动，大秦帝国的统治表面上再次复归于平静，就仿佛昨夜什么也不曾发生。
秦始皇运筹帷幄，对天下反秦势力进行了一次成功的大清洗，迫使反秦势力悄悄隐匿入广阔的江湖之中，修养生息，由此引发的焚书坑儒事件，也使秦始皇得以成功铲除异已，蜃楼也终于扬帆起航，开往海外去寻找长生不老药。
然而，大秦帝国千秋万代的道路上仍然存在着诸多不可忽视的阻碍，一直对中原虎视眈眈的北方狼族，在长期的蛰伏之后，再次爆发起对中原的新一轮冲击，日益频繁的戍边战事，令帝国的铁骑疲于应付。
正传
第一部《秦时明月之百步飞剑》
第二部《秦时明月之夜尽天明》
第三部《秦时明月之诸子百家》
第四部《秦时明月之万里长城》
第五部《秦时明月之君临天下》
第六部《秦时明月之沧海横流》（暂定名）
第七部《秦时明月之亡秦必楚》（暂定名）
3D电影版《秦时明月之龙腾万里》
特别篇天行九歌《空山鸟语 》
页游特别篇（暂定）《罗生堂下》
番外版2DQ版动画《秦时明月之笑闯江湖》
第二部《夜尽天明》
第三部《诸子百家》
第四部《万里长城》以上均已播出
第五部定名为《君临天下》未播
望采纳！