截至2014年底，中国科学院青藏高原研究所全体在职职工248人。包括中国科学院院士1人、中国科学院外籍院士1人（美籍学术副所长）、研究员36人、副研究员40人，包括：基金委“创新群体”2个；“杰出青年基金”获得者10人；“百人计划”入选者18人（藏族1人），国家级百千万工程5人，优青获得者3人。
中国科学院院士：姚檀栋 国家杰出青年科学基金获得者姚檀栋方小敏丁林马耀明田立德徐柏青康世昌阳坤刘勇勤杨永平 中国科学院“百人计划”入选者赵俊猛易朝路康世昌刘景时阳坤张寅生张更新侯居峙苏凤阁张凡颜茂都兰措王磊白玲孔维栋孙亚莉 据2015年9月研究所官网显示，该所设科研有院重点实验室3个，院重点野外台站5个，在此基础上，推动羌塘（双湖）高原站和墨脱低地站的建设；2014年1月21日，根据中国科学院“率先行动”计划和深化科技体制改革要求，依托青藏高原所建设的中国科学院青藏高原地球科学卓越创新中心正式成立，把国内外青藏高原研究力量聚集到一起，实现研究模式新的升级；另有加德满都科教中心。
中国科学院重点实验室（3个）：青藏高原环境变化与地表过程重点实验室、大陆碰撞与高原隆升重点实验室、高寒生态学与生物多样性重点实验室
中国科学院重点野外台站（5个）：纳木错多圈层综合观测研究站、珠穆朗玛大气与环境综合观测研究站、藏东南高山环境综合观测研究站、阿里荒漠环境综合观测研究站和慕士塔格西风带环境综合观测研究站 主要设备仪器序号仪器型号所属实验室1稳定同位素比质谱仪IRMS环境实验室2·有机单体-稳定同位素比质谱仪GC-IRMS环境实验室3·光腔衰荡光谱仪CRDS环境实验室 4·多接收惰性气体质谱仪（HelixMC）碰撞实验室5·电感耦合等离子体发射光谱仪（ICP-OES）碰撞实验室6·激光剥蚀-电感耦合等离子体质谱仪（LA-ICP-MS）碰撞实验室7·水同位素分析仪（WS-CRDS）碰撞实验室8·碳氢同位素分析仪（CM-CRDS）碰撞实验室9·气相色谱-质谱联用仪（GC-MS）碰撞实验室 10MIDISherlock脂肪酸图谱微生物鉴定系统生态实验室11·BiologGenШ多碳源分析仪生态实验室12·IONPGM遗传基因分析仪生态实验室
