《还珠格格》第一部主要讲述了乾隆皇帝东巡与一女子夏雨荷有一段露水姻缘，并生下一个女儿夏紫薇。多年后，夏雨荷病逝，紫薇偕丫环金锁带着乾隆留下的信物，从江南千里迢迢到北京城去与失散多年的父亲相认。主仆两人到京城后根本无法进宫面圣，在走投无路之际遇上了女飞贼小燕子，并义结金兰。小燕子为人热心，愿为紫薇帮忙，中间经过种种挫折磨难，在众朋友鼎力相助下，与乾隆皇帝相见，误会、挫折层出不穷。小燕子以其口才和皇上力争，加上紫薇愿与小燕子同生共死，皇上终于软化，紫薇、尔康、小燕子、永琪这两对有情人终成眷属。
《还珠格格》第二部则讲述了皇宫里新来了香妃公主，这位回族公主并非自愿入宫，并且进宫前就已有了恋人。她的不幸遭遇引起了小燕子的极大同情。在尔康、紫薇的帮助下，小燕子成功地策划香妃逃出宫，而她和紫薇却招致杀身之祸。萧剑、蒙丹、柳青、柳红勇劫法场救出姐妹俩，并汇合尔康、永琪一行七人进行大逃亡。灾难横来，追兵又至！皇上、皇后各怀心机，宫廷内院勾心斗角。经过这番风风雨雨，皇后及容嬷嬷始大彻大悟，且皇太后意识到之前所有的一切一切都是皇后挑拨所造成的，所以她丢下身段向大家说声对不起。在洞房花烛夜那天因为小燕子和紫薇是同时出阁的关系，新娘走错了洞房。
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