首先，老祖宗留下的旧宅基地，不会没有证件，只是你手中未必有证件。1951年结束土改时，全国各地都颁发了人民政府盖章的房产和土地证，该证件中，不仅记录了群众对土地的拥有情况，也记录了农户的宅基地使用情况，并且建有房子的宅基地，和未建房子的空宅基地，都标注得非常清楚，四至八道和面积都有详细记录。
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在当时，政府颁发的土地房产证，农户家中一般存有一份，存根都存在当地政府的档案管理部门。只是由于年代久远，农户中很少有保存此证件的。不过，你手中没有无所谓，完全可以到档案部门查询，根据1951年时你家户主的姓名，完全可以检索得到，查到后复印或拍照留存即可。
不过，这份土地房产证，偏重于对土地的确权。人民公社化后，随着人民公社60条颁布，农村的土地彻底打破私有制，全部归集体所有，这份土地房产证便失去了法律效力，不再能证明土地的所有权情况。但是，就当时的房产来说，这个证件还是有法律效力的，可以证明当时的房产归谁。
所以，如果你家老祖宗留下来的旧宅基地上盖有房屋，档案部门留存的土地房产证，完全可以佐证房子的所有权。而农村的房子是私有财产，可以依法继承。传到你这一辈，如果这房子还在，前面换发房产证时没有办理，在这次农村房产确权中，完全可以持旧土地房产证和传承关系证明，办理该房产的确权手续，确定房产权属和宅基地使用权。
不过，如果老祖宗留下来的只是旧宅基地，没有建设房屋，当时一般称为屋夼，在土地改为公有制后，你家传的没有建房的土地便会收归村集体所有，如果没有申请使用权，虽然其为家传 ，但也失去了土地使用权。过去的土地房产证，只能证明你家曾经拥有过此土地，不能证明现在还拥有对该宅基地的使用权。而根据农村宅基地管理办法，空闲两年以上的宅基地，就可以收归集体，农民丧失了使用权，你家就无法再主张该土地的使用权了。
并且，农村房产确权和宅基地确权，是针对宅基地上有房屋的土地，空宅基地不存在确权问题。因此，你所说的祖上留下的宅基地，如果现在还有房屋存在，即使超过一户一宅的宅基地管理规定，也可以办理房屋确权，并享有宅基地使用权。但是，如果你祖上留下的只是空闲的宅基地，则该地早已经收归集体，不存在补办手续问题。如果你想继续使用，就要符合宅基地申请条件，依法进行申请。