女主叫艾斯蒂尔，男主叫约修亚，简单的说，空轨FC（也就是第一部）讲的是艾斯蒂尔的爸爸不明失踪，然后男女主踏上寻找父亲的征程，当然因为他们刚刚成为见习游击士，所以也是一路的成长，最后他们成为了正式的游击士，艾斯蒂尔的父亲也回来了。
SC（也就是second chapter，第二部）讲的是男主因为自己黑暗的身份离开了女主，然后女主励志要将他找回来，然后他们所处的国家利贝尔发生了一系列诡异奇怪的事情，女主和她的同伴一起去解决，最后找回男主，成功解决了国家的危难。
3rd（也就是第三部）则换了一对男女主角，男主凯文在第二部以配角出现，是一名神父，而这一部里面的世界是异空间，空轨中的主要角色会出现，经典场景也会出现，然后男女主的身世也会被揭露，第三部比起前两部的剧情弱了一些，但是在游戏画面上强了不少，然后还有一些小游戏。
当然这是简单的说说，空轨的剧情很感人，有关于亲情，爱情和友情的，值得自己慢慢去打去体会，可玩性很高。关于游戏中各个人物的魔法链的配置也需要去思考探索。
温馨提示：答案为网友推荐，仅供参考