办公自动化系统是人机信息系统，是办公自动化技术与管理科学、行为科学、组织理论等相融合，贯穿到办公活动的各个方面，并对这些方面产生一系列影响之后形成的系统，其目的是尽可能充分利用信息资源，提高办公质量和办公效率。
办公自动化系统是一种人机信息系统，具有一般信息系统的共性。同时，由于办公过程和办公活动具不有确定性，人在系统中应始终处于主导地位。办公的主体是办公人员，设备只是服务于人的技术手段。建立办公自动化系统后，人的办公活动和社会组织的办公过程已离不开设备的运行，而是与其结合在一起形成一个统一的系统。建立办公自动化系统的目的并不单纯是提高办公效率或减少办公人员，而首先是为了提高办公质量，在提高办公质量和办公效率的基础上，通过各种决策模型及时提供辅助决策的信息，以实现科学管理和科学决策。此外，办公自动化系统是一个开放式的系统。在设计和建立系统时，应充分考虑和社会环境的连接。
办公自动化系统的功能与办公室自动化的功能概念上存在差别。办公室自动化功能通常指办公室中配备具有自动化功能的设备，这些设备能使某些办公活动自动化或实现某个单位业务的自动化处理；而办公自动化系统则是在办公室自动化功能的基础上发展起来，以办公自动化技术为主体，同人、组织、制度、环境等相结合的完整的系统。
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