两者区别如下：
一、概念不同
1、水手服，是服装的一种，水手服的起源来自于早期英国海军的服装，也叫海员服，甲板服。后来在英国国内作为儿童服装流行。日本许多学校采用水手服作为学校校服。
2、JK制服，为日语流行语，意为女高中生（じょしこうこうせい）。取假名音 jyoshikoukousei中的J和K。JK制服的种类繁多，细分的话，有非常繁多的款目。
二、特点不同
1、水手服，在前面会有一个丝带构成的领结。丝带形式主要包括：领带式、饰扣式和弓形式。常见的颜色为海军蓝、白色、灰色及黑色，但是一般以蓝色、黑色、灰色多见。襟线多见为三本线。
2、jk制服，根据领子外形不同分为札幌襟，关东襟，关西襟，名古屋襟四个种类。又根据领子上的襟线多少、颜色不同分为繁多的类型，襟线是什么颜色、有几根襟线就是辨别类型的标准。
三、特色不同
1、裙子分轮褶、箱褶、百褶。裙子一般是及膝的，但日本女生喜欢在腰部把裙子折起来，使其短到不能再短，她们认为那样可爱，短裙校服已经成为群体意识 。
2、裙子根据褶皱排列不同有不同称呼：大抵为箱褶，轮褶，前箱褶，还有比较少见的重褶。裙子的褶皱数也是可以不同的，像较为常见的轮褶，褶数可以为16，20，24，28，32，通常为24褶。
参考资料来源：百度百科-水手服
参考资料来源：百度百科-JK制服
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