法律分析：1．领导关系，是政府机构之间最重要的关系，一般出现于不同层级的政府机构中。其特征是：上级政府机构有权对下级机构下达各种指示或命令，对此，下级机构必须全面遵从。
2．指导关系，一般出现于上、下级政府主管同一类业务的职能机构中。其特征是：上级政府机构有权就某一方面的业务作出政策性的指示，或对某一具体事务发表指导性的意见，但这些指导意见对下级政府机构一般没有完全的约束力，下级机构有权根据自己的情况决定是否遵从及遵从的程度。
3．协调关系，一般出现于本级政府的不同机构中。其特征是：行使协调权的机构在与有关方面协商的基础上，有权就某些政策问题或具体事项作出决定，该决定对有关部门有一定的约束力。
4．业务关系，一般发生于互不统属的政府机构之间。其特征是：某一政府机构在其职权范围内就特定事项发布的管理规定，从事该事项的其他政府机构都有遵从的义务。
5．协作关系，也主要发生于互不统属的政府机构之问。其特征是：对其他政府机构请求办理的合理事项，本机构应尽可能提供方便，予以办理。
法律依据：《中华人民共和国中央人民政府组织法》
第五条 中央人民政府委员会组织政务院，以为国家政务的最高执行机关；组织人民革命军事委员会，以为国家军事的最高统辖机关；组织最高人民法院及最高人民检察署，以为国家的最高审判机关及检察机关。
第十四条 政务院对中央人民政府委员会负责，并报告工作。在中央人民政府委员会休会期间，对中央人民政府的主席负责，并报告工作。
第二十六条 最高人民法院为全国最高审判机关，并负责领导和监督全国各级审判机关的审判工作。