法律分析：1、办理手续时，支付经济补偿金不同
辞职申请书和辞职信两者的根本区别，就是用人单位收到辞职信后给劳动者办理辞职手续时不必支付经济补偿金。而用人单位在收到辞职申请书后做出同意的意见或者盖章，则视为双方协商达成一致解除劳动合同，用人单位必须支付经济补偿金。
2、方式不同，意义也不同
离职申请和辞职报告，两者都是辞职的表达，但报告是宣告、告诉，而申请是向上级说明理由，提出请求。
3、辞职过程不同
辞职报告属于单方要求，不能作为职工提出辞职的证据使用，而离职申请在经过上级同意审批过后，方可认为完成了辞职的过程。
法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》 第三十八条 用人单位有下列情形之一的，劳动者可以解除劳动合同：
（一）未按照劳动合同约定提供劳动保护或者劳动条件的；
（二）未及时足额支付劳动报酬的；
（三）未依法为劳动者缴纳社会保险费的；
（四）用人单位的规章制度违反法律、法规的规定，损害劳动者权益的；
（五）因本法第二十六条 第一款规定的情形致使劳动合同无效的；
（六）法律、行政法规规定劳动者可以解除劳动合同的其他情形。
用人单位以暴力、威胁或者非法限制人身自由的手段强迫劳动者劳动的，或者用人单位违章指挥、强令冒险作业危及劳动者人身安全的，劳动者可以立即解除劳动合同，不需事先告知用人单位。