一、两者之间最突出的不同在于：
中科院院士的成长，主要靠重点
综合大学和大师的熏陶；而工程院院士的成长，主要靠重点理工科大学和大量的工程技术实践成为一名杰出的科学家或技术专家.
以中科院院士为代表的高级科学人才，是在科学技术领域作出系统的、创造性成就的者；而以工程院院士为代表的高级技术人才，是在工程技术方面作出重大的、创造性成就和贡献的专家。两者虽都是高级人才，但工作性质不同，成才的影响因素也可能不同。
二,是什么衔？
中国科学院搞科研，理论等，中国工程院搞工程，技术。
二者主要是入选的标准不一样。可以说是教授和工程师的差别。
没有谁比谁更牛一些，标准不一样啊。
当然有人既是科学院院士又是工程院院士。
没什么头衔，除院士的称号，但是都是中国科技的权威，代表中国科技的最高水平，备受人爱戴。
中国工程院是中国工程科技界的最高荣誉性、咨询性学术机构。主要任务是对国家重要工程科学技术问题开展战略性研究，提供决策咨询，致力于促进中国工程科学技术事业的发展。工程院成立于1994年，现在拥有662名院士。
三,两院院士申报条件
1、
中国科学院院士申报条件
在科学技术领域做出系统的、创造性的成就和重大贡献，热爱祖国，学风正派，具有
中国国籍的研究员、教授或同等职称的学者、专家，可被推荐并当选为中国科学院院士。
2、
中国工程院院士申报条件
在工程科学技术方面作出重大的、创造性的成就和贡献，热爱祖国，学风正派，具有中国国籍的高级工程师、研究员、教授或具有同等职称的专家（含居住在
香港特别行政区和台湾省、澳门地区，以及侨居他国的中国籍专家），可被提名并当选为中国工程院院士。