据考古发现，新石器时期，今天的丁家洼村一带已有人类活动。 殷商时期，在古燕山脚下，出现了一个和商同期形成的小国——郾，属部族的方国。据专家考证，殷商时所说的燕山，就是今天的大房山。所以，房山地区的历史建置，至少可以上溯至古燕国时期。后来，周武王兴兵灭商，同时灭掉了自然形成的小国燕国，将其封给战功卓著的召公，时间大约在公元前11世纪，距今已3000多年。周初分封的燕国，在古燕国基础上建立，其都城遗址就是琉璃河燕都遗址。 战国燕时，设中都县。
秦汉之际，中都改为“良乡”。汉初，今房山地区曾置良乡（侯国）、西乡（侯国）和广阳县，良乡县城在今窦店村西，即俗称的“窦店土城”。依地理位置分析，今房山地区当属良乡县。此后，历三国、两晋、南北朝至隋、唐，隶辖关系未变。
唐代，幽州良乡县辖12乡。
五代时，刘仁恭占据大安山，属地方割据。刘仁恭奉道士王若讷为师，并单划出一县——玉河县。据赵其昌《辽代玉河县考》，玉河县范围从今天门头沟三家店一带起，包括大安山、良乡、房山，直到石窝。玉河县废止时间，在金天眷元年（1138年）。
金大定二十九年（1189年），为奉山陵，始析良乡、范阳、宛平三县边地，置万宁县。
金明昌二年（1191年），改万宁县为奉先县。
元至元二十七年(1290年)，改奉先县为房山县。
1986年，撤销房山县、燕山区，设立房山区，以燕山区和房山县的行政区域为房山区的行政区域。1997年11月17日，国务院批准将房山区人民政府驻地迁至良乡。
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