主要是职能不同。森林公安局专门保护森林及野生动植物资源、保护生态安全、维护林区社会治安秩序的重要力量；普通公安局的业务可以简单划分为：刑事、治安、交通管理、消防、出入境、人口管理、国内安全保卫等。
森林公安是国家林业部门和公安机关的重要组成部分，是具有武装性质的兼有刑事执法和行政执法职能。多年来，在各级党委、政府和林业、公安部门的领导下，森林公安机关和广大森林公安民警牢记“以警为荣，以林为业”和“立警为公、执法为民”的理念，忠实履行法律职责，有力地打击了各类破坏森林和野生动植物资源的违法犯罪活动，为生态建设和林业发展做出了巨大贡献。
扩展资料
主要职责是：
1、组织协调、指导监督全国森林防火工作，发布森林火灾信息；指导森林公安工作，管理森林公安队伍；协调和监督查处特大森林案件；联系林业检察院、法院。
2、拟定森林公安、森林防火工作的政策、法规、制度、标准，并监督执行。
3、指导全国森林公安工作，组织协调、指导、监督全国森林防火工作。
4、编制森林公安、森林防火的发展建设规划并组织落实，组织指导森林公安、森林防火装备、基础设施建设，监督检查专项资金使用落实情况，承担警用装备和森林防火专用物资的申请、购置、调拔工作。
5、指导森林和野生动植物资源保卫工作，分析、掌握本区社会治安动态。
6、组织、指导全国森林公安机关林业行政执法工作和森林防火行政执法工作。
7、协调组织打击破坏森林及野生动植物资源违法犯罪活动的统一行动和专项斗争及专项治理，督促查处破坏森林资源、国家重点保护野生动植物资源的特大案件。指导林区治安综合治理工作。
8、指导全国森林公安队伍建设，承担掌握森林公安机构设置、警力配备、警衔审批、领导干部协管、立功授奖工作；组织、指导森林公安教育培训、警务督察、宣传工作；掌握和督察民警违法、违纪案件。
9、制定并实施全国特大森林火灾的扑救预案，承担国务院交办的扑救特大森林火灾的组织协调工作。
10、承担林火监测和火灾预测、预报工作，掌握全国火情动态，发布火灾信息。
11、指导全国森林火灾预防、扑救工作及专业队伍建设，实施森林消防监督，指导、协调航空护林工作，承担与周边国家森林防火协定的履约工作。
12、指导、协调武警森林部队森林防火、扑火业务工作。
13、领导森林火灾预报监测信息中心。
14、承担国家林业局检察院法院工作办公室的工作。
15、归口管理东北航空护林中心、西南航空护林总站、南京森林警察学院，协管长春森林公安培训中心。
16、承办国家林业局、公安部交办的其他事项。
参考资料：森林公安--百度百科
公安局是公安机关的组织形式，是主管公安工作的政府下设职能部门。受所在地政府、上级公安机关双重领导。