《宣言》第一章标题就是“人类尊严与人类基因组”，第一条便开宗明义：人类基因组意味着人类家庭所有成员在根本上是统一的。人类只有一个基因组：正常的基因组。
人类所有基因，以及等位基因，没有“好基因”与“坏基因”的差别。人害的基因组，更没有“正常的基因组”与“疾病基因组”的差别。导致某种疾病的等位基因，一方面在一定的情况下确实是病因；另一方面要看到：人类基因组在进化过程中一定会发生突变，一定是在整个人类有意义的。现在，几乎所有频率高的隐性基因都是这样。如“镰刀状细胞贫血”，现在已知它的杂合子对疟疾有一定的抗性；白种人中频率最高的“囊性纤维变”杂合子很可能对霍乱、伤寒等传染病有抵抗力。这种多样性，是人类作为群体，在不同的环境下赖以生存的保证。
但是，按照基因传递规律，这样致病的等位基因存在，肯定要以一定的机率“纯化”，不可避免地会产生这种遗传病的病人。在这个意义上说，遗传病患者是承担了人类不可避免的痛苦。正如老话说：“村头七十八家，不是你家便是我家——家家难免”，“未到七十八，不要管别人鼻塌眼瞎”。对弱者、不幸者的怜悯，照顾好包括遗传病在内的残病者，是一个国家社会文明的标志。
我们还要从疾病的自然、社会与个人属性，来正确对待疾病。从自然的角度来说，作为生物的人类，一定会有天敌或寄生虫的，一定会依附别的生物的。疾病的苦痛，是人类御病原的一种反应。疾病，又是一个机体损坏到一定程度毁灭这一个体的自然手段之一。但是，从疾病的社会属性与个人属性来说，医学，是对人类自然属性及自然界的一种挑战，这种挑战是有限度的，要尊重自然规律。尽力建立人与自然界的平衡与默契。每一个人都有追求幸福、免受痛苦的权利。一个文明社会应保障这一权利。即使是一个无肛门的婴儿出生，我们也要让他活下去。整个社会一定要把他的生死，看成是我们整个社会愿意接受的来自自然界的挑战。这绝不意味着他是社会的累赘。相反，对他权利的尊重，是人类已经做出的一种社会选择。
每一个人的基因组，都带有几百个致病的等位基因。基因组只有多样性，没有好坏的差别。每一个人都会因自己的基因而生病，但每一个人的基因组，包括遗传病人的基因组，都是正常的，绝对不只为生了一种或几种病，就称之为“疾病基因组”。“疾病基因组”这样的用词，很容易被误解的。相反，人类基因组，是全人类的宝贵遗产，是人类生存到今天、发展到明天的根本基础。因此，我们才要在道义上、实际行动上保护全人类的基因组。
人类只有一个基因组，全人类所有成员在根本上是一致的，对任何一个人基因组的研究，代表了全人类的一致性信息。通过比较，可以得到与疾病有关的突变或等位基因的信息，以及各个人种、群体、个体的特殊性的基因信息。任何一个人的基因组，如“人类基因组计划”选定的无名男氏的基因组序列，就代表了人类基因组的“参照”基因组。
人类基因组的“参照”序列，蕴藏着全人类与生、老、病、死有关的全部信息，将奠定从此以后生命科学、医学以至于生物产业发展的基础，是不应该有专利的。“人类基因组计划”倡导的“全球合作、免费分享”的HGP精神，已成为人类自然科学史上国际合作的楷模。
全球合作，就意味着每一个国家、每一个实验室都有参与的权利。只要是负责的、技术上能胜任的，所有参与者都是无报酬的贡献者。因此说，“人类基因组计划”，比“曼哈顿”原子弹计划与“阿波罗”登月计划，更加全面地反映了人类的进步与和谐。