孩子在出生后第二天即可接种卡介苗。接种后，可获得结核菌的一定免疫能力。卡介苗接种一般在左上臂三角肌处皮内注射，也有在皮肤上进行划痕接种，做“艹”或“井”字形，长1厘米。划痕接种法虽方便，但因接种量不准，有效免疫力不如皮内注射法。故目前一般不采用划痕法。
新生儿接种卡介苗后，无特殊情况一般不会引起发热等全身性反应。在接种后2～8周，局部出现红肿硬结，逐渐形成小脓疮，以后自行消退。有的脓疮穿破，形成浅表溃疡，直径不超过0.5厘米，然后结痂，痂皮脱落后，局部可留下永久性疤痕，俗称卡疤。为了判断卡介苗接种是否成功，一般在接种后8～14周，应到所属区结核病防治所再作结核菌素（OT）试验，局部出现红肿0.5～1.0厘米为正常，如果超过1.5厘米，需排除结核菌自然感染。一般新生儿接种卡介苗后，2～3月就可以产生有效免疫力，大约2～5年后，在小学一年级时，再进行OT试验，如呈阴性，可再种卡介苗一次。
早产儿、难产儿以及有明显先天畸形、皮肤病等的小儿，禁忌接种。