1、烘干鸡粪基本上未经无害化处理。鸡粪烘干过程，靠短时间、较高温度是不会彻底杀灭一些较顽 固的有害病毒、病菌、病虫害和杂草种子的。
2、发酵鸡粪是在生物菌的分解作用下温度升高，并保持60-70℃连续几天。所以基本能杀灭病毒、 病菌、病虫害和杂草种子达到无害化标准。
鸡粪的加工处理方式多种多样，有物理方法、 化学方法、微生物发酵法、多种方式综合法，其洋法与土法、古老与现代并存，各有优劣，应因地制宜。
鸡粪发酵作肥料的传统老办法是，让其自然堆积发酵5~6个月，作饲料也要二十天或一个月左右，这样臭味散发,既污染环境又造成养分大量流失。
而用微生物发酵法处理鸡粪，不仅能加快发酵过程，缩短发酵时间，防止浪费提高鸡粪的营养价值；而且能通过发酵产生温度烘干鸡粪，节省能耗，成本低廉，操作简单，易于推广，因而受到用户欢迎。
区别：
投入成本的对比
烘干方式：鸡粪烘干是需要用电或者煤作为能源，并且还需要购买专门的烘干设备。
发酵方式：鸡粪发酵是在鸡粪中添加液态复核生物菌来将鸡粪腐熟而成，需要建设大型的发酵池，这样折算下来每吨发酵鸡粪成本价应该在360-430元之间。
灭菌效果的对比
烘干方式：烘干鸡粪基本上是经过简单的无公害化处理。
发酵方式：发酵鸡粪是在液态生物菌的分解作用下。
能源消耗对比
烘干方式：每生产一吨烘干鸡粪需要消耗煤大约在160-200kg，耗电量大约在32-40度。
发酵方式：发酵鸡粪是在生物菌的作用下，高温腐熟而成的。
鸡粪烘干机
目的是烘干鸡粪，将干鸡粪重新添加化肥辅料制成:鱼饲料，果树饲料等销售。鸡粪烘干机最大的性能特点就是除尘又除臭，鲜鸡粪可变猪饲料，废品也是有机肥,鸡粪烘干机可以把高达70%-80%含水量的粪便烘干到13%含水量的粪便。
鸡粪烘干机运行的整个过程处于全封闭状态。即可以减少对环境的污染又可以起到节能环保的作用。鸡粪烘干机是制作纯鸡粪有机肥的必要设备。鸡粪烘干机纯鸡粪有机肥是以鲜鸡粪为主要原料。经彻底去尘、净化、高温烘干、浓缩粉碎、消毒灭菌、分解去臭等工序，精制而成。含有农作物所必需的多种营养元素，
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