根据民政部1998年12月10日发布的《大陆居民与台湾居民婚姻登记管理暂行办法》和2003年10月1日起施行的《婚姻登记条例》规定，台湾居民与大陆居民的结婚登记应按照如下规定办理：（1）申请结婚登记的大陆居民应当提交下列证件和证明：·本人的户口簿、身份证。·本人无配偶以及与对方当事人没有直系血亲和三代以内旁系血亲关系的签字声明。（2）申请结婚登记的台湾居民应当提交下列证件和证明：·本人的有效通行证、身份证。·经居住地公证机构公证的本人无配偶以及与对方当事人没有直系血亲和三代以内旁系血亲关系的声明。·台湾居民在香港、澳门地区连续停留6个月以上来大陆的，除提交上述证件、证明外，还应当提交香港婚姻注册处或澳门婚姻及死亡登记局出具的婚姻状况证明。台湾居民在外国连续停留6个月以上来大陆的，除提交上述证件、证明外，还应当提交居住国出具并经公证机关和中华人民共和国和国驻该国使、领馆认证的婚姻状况证明。大陆居民赴台湾地区定居时已达到法定婚龄的，应当提交经大陆原居住地公证机关公证的赴台湾的婚姻状况证明。·申请结婚登记的当事人离过婚的，应当提交离婚证件。离婚证件系台湾 离婚协议书 的，应当经台湾公证机关公证；无法提交离婚协议书的，应当提交公证的台湾地区报纸刊登的当事人离婚的声明书或公告，未经公证的影印件 不具有法律效力 。离婚证件系台湾地区有关法院的 离婚判决书 或 离婚调解书 的，如果离婚的一方系大陆居民，该离婚判决书或调解书应当经人民法院裁定认可。离婚证件系外国登记离婚证书的，应当经驻在国公证机关公证、驻在国外交部或外交部授权的机关论证，并经中华人民共和国驻外、领馆认证。离婚证件系外国法院的离婚调解书或离婚判决书的，应当经中华全国法院裁定承认。·丧偶的，应当提交配偶死亡证明。死亡证明系台湾地区有关部门出具的，应当经台湾公证机关公证。死亡证明系外国有关部门出具的，应当经驻在国公证、驻在国外交部或外交部授权的机关认证，并经中华人民共和国驻外使（领）馆认证。
在两岸通婚中，台湾人与大陆人结婚，他(她)们倍感头疼的问题，就是关于结婚手续和计划生育问题。民政部有关负责人告诉说，自台湾当局允许一般民众到大陆探亲以来，海峡两岸民众之间的交往日渐增多。若台湾同胞在大陆要求与大陆同胞结婚，政府有关部门已就台湾同胞与大陆同胞之间办理结婚的有关问题作了规定。对已在大陆定居和临时来大陆探亲、旅游、经商的台湾同胞申请与大陆同胞结婚，分别规定了受理机关和所需证件。已在大陆定居的台湾同胞要求与大陆同胞结婚，按照1986年3月15日民政部发布的《婚姻登记办法》，由县级以上民政部门受理。申请结婚登记的台湾同胞一方当事人，应向婚姻登记机关提供其在大陆定居后所在单位或户口所在地的居民委员会或者村民委员会出具的婚姻状况证明，以及在大陆定居前的婚姻状况证明。其中，回大陆定居前在台湾居住的，须提供台湾公证机关出具的无配偶证明或经公证的本人户籍登记簿底册复印件;离台后移居港澳地区半年以上来大陆定居的，须提供台湾司法部委托的香港律师确认的婚姻状况证明或澳门婚姻及死亡登记局出具的婚姻状况证明;离台后移居外国半年以上来中国大陆定居的，须提供由其居住国公证机关出具并经大陆该国使、领馆认证的无配偶证明。无法取得上述证明的，应提供由本人亲自填写并经大陆居住地公证机关公证的《无配偶声明书》。鉴于海峡两岸的现状，临时来大探亲、旅游、经商的台湾同胞与大陆同胞结婚后，会给双方当事人的生活带来诸多不便。因此，对于这类申请，更须慎重，由省级人民政府指定的婚姻登记机关受理。省级人民政府指定的婚姻登记机关在受理这类结婚申请时，要求台湾同胞一方当事人提供下列证件：(一)、香港中国旅行社代办的槿公安机关边防检查部门签发的在有效期内的《台湾同胞旅行证明》或大陆驻外使、领馆(含中华人民共和国外交部驻香港、澳门签证办事处)签发的加注有“台湾同胞”字样的《中华人民共和国旅行证》或《中华人民共和国护照》。(二)、公安机关出具的《暂住户口证明》。(三)、本人身份证件或婚姻登记状况证明。其婚姻状况证明与定居大陆的台湾同胞申请与大陆同胞结婚时所持来大陆定居前的婚姻状况证明相同。无法取得上述证明的，不得用《无配偶声明书》的方式代替。(四)、婚姻登记机关指定的医院出具的婚前健康检查证明。如果当事人是从大陆去台湾定居的，在回大陆省亲、旅游、经商期间申请与大陆同胞结婚时，还须提供其在大陆原居住地公证机关公证的无配偶或虽有配偶、但已离异或死亡的证明。在台湾或港澳地区居住的，已离婚或丧偶的台湾同胞申请与大陆同胞结婚时应提供经台湾公证机关公证的，或大陆司法部委托的香港律师证明的，或澳门婚姻及死亡登记局出具的离婚证明或配偶死亡证明。无法提供上述证明的，可以提供经公证的台湾或港澳报纸刊登的当事人的声明书或公告，未经公证的影印件不具有法律效力。在外国居住的，已离婚或丧偶的台湾同胞，其离婚证件或配偶死亡证明应按规定办理公证、认证手续。关于已在外国或港澳取得永久居住权的台湾同胞，已经取得外国籍的，申请与大陆公民结婚，分别按华侨、港澳同胞、外国人的身份，按照《华侨同国内公民、港澳同胞同内地公民之间办理婚姻登记的几项规定》和《中国公民同外国人办理婚姻登记的几项规定》，由省级人民政府指定的婚姻登记机关受理。台湾同胞在大陆结婚后，该婚姻关系在台湾岛内的效力问题就现阶段而言，因两岸人员往来的单向性，决定了涉台婚姻中的绝大多数，是台湾同胞在大陆的婚姻登记机关办理结婚登记事宜。因此，婚姻双方当事人，最好通过以下法律途径来保障自己的权益。一、办理婚姻公证。结婚双方当事人在取得大陆婚姻登记机关所颁发的《结婚证》后，应共同到大陆一方当事人的户籍所在地，在可以办理涉外公证的公证机关办理《婚姻关系公证书》，并可要求公证部门将该公证书的副本寄往台湾的海基会，以便日后之验证。二、申请验证。当事人将所办的《婚姻关系公证书》的正本提供给台湾海基会，申请进行验证。但事先最好将申请验证的公证书复印留底，或将其公证编号记录下来。提供方式可以是台湾一方当事人将公证书正本交至海基会;也可以由大陆一方当事人将公证书正本自行邮寄至海基会，但应注明将验证通过后的公证书正本寄回的地址;也可以委托在台湾的其他亲朋好友办理有关验证事宜。三、申请户籍登记。台湾有关方面规定，“结婚，应有公开仪式及二人以上之证人。经依‘户籍法’为结婚之登记者，推定其已结婚。”虽然台湾当局规定，结婚双方当事人必须到相关部门进行书面登记，但现阶段，大陆一方当事人去台湾办理结婚登记的可能性几乎没有，这也就表示，在大陆所缔结的婚姻关系，现阶段只能通过办理“户籍登记”的方式，来实现其在台湾的合法性。根据台湾有关方面规定，“结婚登记，以当事人为申请人”，并“应于申请时提出证明文件”，即在申请办理户籍登记时，当事人必须提供被台湾当局承认的证明文件。这里的“当事人”包括大陆一方的当事人，即无论台湾，还是大陆方面的当事人，双方均可申请办理户籍登记;“证明文件”指的是由大陆公证机关出具的，且经过台湾海基会验证通过，并“推定为真正之文件”的《婚姻关系公证书》。另外，大陆一方当事人还可以“利害关系人”的身份向台湾的户政机关提出申请，要求该户政机关提供台湾配偶的户籍，以确保婚姻在台湾岛内的合法性，及自身的合法权益得以保障。大陆和台湾实行的是不同的婚姻管理制度。大陆实行的登记制，当事人双方到婚姻登记机关办理登记手续，取得结婚证即确立婚姻关系。而台湾地区主要实行的是仪式制，即：有公开仪式及二人以上之证人，婚姻即有效成立。婚后到户籍登记处报备，但如果当事人不主动去报备，也并不对其婚姻本身造成影响。台湾地区居民到大陆结婚，需出具无配偶证明，而这个证明是根据本人户籍底册上没有结婚的记载而开出的。这种证明可以同时出具几份，也可以多次出具，并不注明将与之结婚的大陆配偶的姓名，于是便出现了漏洞。有过这样一个趣谈，结婚一年多的台湾丈夫对大陆妻子开玩笑：“如果我和你结婚后，再去台湾结婚;或者在和你结婚前，我已经在台湾结过婚，你也不知道。如果我没有把我的真实婚姻情况到户籍登记处报备，你是无从查起的。”