旗舰店、专卖店不同：
一、实质不同：
1、旗舰店的实质：旗舰店一词来自欧美大城市的品牌中心店的名称，其实就是城市中心店或地区中心店。
2、专卖店的实质：指专门经营或授权经营某一主要品牌商品（制造商品牌和中间商品牌）为主的零售业形态。
二、特点不同：
1、旗舰店的特点：
（1）权威性。有效肃清假冒伪劣产品，起到以正视听的作用。
（2）身份明确。维护消费者的知情权益。
（3）经营稳定。长期经营不是短期行为，能有效维护自身形象及消费者利益。
（4）值得信赖。能让网购者真正放心购物，明白购物。
（5）成本低，效率高。这是一般网店所具有的特点，作为官方网店效果更明显。
2、专卖店的特点：
（1）选址在繁华商业区、商店街或百货店、购物中心内。
（2）营业面积以著名品牌、大众品牌为主；销售体现量小、质优、高毛利。
（3）专卖店是品牌、形象、文化的窗口，有利于品牌的进一步提升。
（4）能有效贯彻和执行文化及活动方针，有效提高集团的执行力，突破现代企业所普遍面临的管理瓶颈。
（5）专心专业、专卖一类产品或一个品牌，大大增强产品的终端销售能力。
（6）更多的创造顾客购买一类产品或一个品牌的系列产品（专卖+优质产品+星级服务）的机会，提升产品的销量。
三、意义不同：
1、旗舰店的意义：旗舰店不仅仅是一个概念、一个品牌、一种哲学、一套生活方式，旗舰店也应该是形象的旗舰店，用来更好地展示企业品牌形象；还应该是销售的旗舰店，要有好的销售业绩；更应该是管理的旗舰店，可以高效地管理商店（其中包括对员工的管理）。
2、专卖店的意义：专卖店是公司品牌、形象、文化的窗口，有利于公司品牌的进一步提升；能有效贯彻和执行公司文化及活动方针，有效提高集团的执行力，突破现代企业所普遍面临的管理瓶颈；专心专业、专卖公司品牌，大大增强公司产品的终端销售能力。
参考资料来源：百度百科-旗舰店
参考资料来源：百度百科-专卖店
本回答被网友采纳两个概念 有类似的部分 有交集 但在用词的目的上有本质的区别
但是一般使用的时候 基本上属于乱用 没有必要太过纠结
大致的区别是这样的
专卖店 指的是专门销售某一种产品的店 通常是指专门某一个品牌 专卖一种品牌的店
而旗舰店 就要从“旗舰”这个词解释起 旗舰来源于英文当中的flagship的直译
flagship本身就是一个舰队当中的悬挂旗帜标识的那艘船 后引申为标志性的人或事物
在一个品牌当中 就是招牌式的产品 或者顶尖的产品就成为旗舰产品
所以如果是一个服装品牌的话
专卖店 就是专卖这个品牌所有商品的店 不管是尖端系列 还是入门级别的产品
旗舰店 就主要只销售尖端系列
本回答被网友采纳区别：
一、旗舰店是要自己的品牌，一般都是厂家；专卖店是只能卖一个品牌，可以是代理
专营店就像卖场一样，什么牌子都行。
二、旗舰店---品牌的持有者/持有公司自己开的商城店。
专卖店---品牌的一级授权商/代理商/分销商，只能经营一个品牌。
专营店---同时可以经营多个品牌，所经营品牌可以自有，也可以由品牌商授权或品牌授权商授权。
旗舰店、专卖店、专营店比较
旗舰店是官方开的，最有保障。
专卖店跟实体的专卖店差不多，最放心。
专营店是专门经营某一种类的，比如服饰专营店，那么他可以经营多个品牌的服饰，但种类只能是服饰，这种店容易卖假货。本回答被网友采纳