北京中医药大学附属护国寺中医医院、北京针灸医院医院大抓重点专科建设，注重名科、名医的打造。目前，医院有国家级重点专科两个：针灸科及骨伤科，北京市市级诊疗中心三个：中医特色针灸诊疗中心；中医特色骨伤诊疗中心；中医特色肿瘤诊疗中心。医院还成立了吴定寰名医传承工作站,许彭龄名医工作站,张吕夫、鲁承业、周玉宗、金宇安市级基层老中医传承工作室,王居易名医传承工作室，北京市星火“3+3”室站工程项目师生共32人。 北京中医药大学附属护国寺中医医院针灸科有60年悠久的历史,建院之初云集了金针王乐亭、贺惠吾、夏寿人、贺普仁、于书庄等名医在我院出诊。1982年建立针灸科病房。现在针灸科为国家级临床重点专科、国家“十二五”重点专科建设项目。2012年成立北京中医药薪火3+3王居易名医传承工作站。针灸科设有5个病房，201张病床，共有医生65名，其中硕士生导师2人；主任医师3人；副主任医师10人；博士2人，硕士35人。以北京市名老中医王居易、王丽平为学术带头人；周炜为学科带头人，以经络医学理论指导下的不同针法（头针、腹针、体针、火针、揿针、耳穴压豆、穴位贴敷等）结合中药治疗疾病为特色，擅长治疗中风、眩晕、面瘫、消渴、痹证、肿瘤、胸痹等疾病。门诊设有中风、眩晕、面瘫、眼病、小儿近视、痹证、颈腰椎病、甲亢、睡眠障碍、更年期综合征、痤疮等专病专台。针灸科对中风及其危险因素的诊治具备特色，从针-体-药相结合的治疗方法，逐步扩展到经络医学理论指导下的不同针法、仲景经方、神经训导康复锻炼的诊疗模式，极大的提高了中风患者的疗效。并且“不同针法治疗中风”、“循经切按法指导治疗中风”“穴位贴敷疗法预防中风”等适宜技术通过多年的临床科研实践已经纯熟应用于临床。针灸科始终将患者利益放在首位，追求学术创新，沿用传统疗法，为百姓提供满意的疗效。
