影响食品安全的因素有生物污染、环境污染、农药与兽药残留污染。
1、生物污染
在食品加工制作及包装储运过程中，如果质量检验、消毒措施等方面把关不严，就给微生物、
寄生虫、生物毒素等创造大量繁殖的机会，极易造成
食物中毒。由病原微生物引起的食物中毒事件时有发生，是日常生活中比较常见的食物中毒，特别在气温较高的夏、秋季节更是高发时节。
2、环境污染
环境污染主要以重金属污染及有机物污染为重点，多以工业生产如采矿、废气排放、污水灌溉及使用重金属制品等人为因素所致，对人体及食品安全的污染影响最为严重。有机污染物中的二恶英、
多氯联苯、环
芳烃等工业化合物及副产物，也是毒性较强的物质，能在环境和
食物链及人体内富集，是影响食品安全的重要因素之一。
3、农药与兽药残留污染
目前，在家禽、畜和水产品中普遍存在大量使用抗生素、磺胺类、激素等化学药物现象，这些物质残留量往往超标存在于动物组织中，大大增加了潜在的食品安全问题。比如“
瘦肉精”其实是一种兴奋剂，因为能使禽、畜产生足够的瘦肉而被大量使用，食用残留超标的“瘦肉精”食品，轻者引起中毒，严重者甚至死亡。