阳泉市疾病预防控制中心的内部机构设有多个部门，各司其职，确保了公共卫生服务的高效运行。以下是各部门的详细信息：
1. 办公室：编制8名工作人员，实际岗位需求2人，主要负责日常行政管理和协调工作。
2. 综合科：编制10人，实际职位2个，负责综合性事务和信息管理工作。
3. 业务与健康教育科：编制5名，1个职位，致力于健康知识的推广和疾病预防指导。
4. 流行病科（皮肤性病防治所）：编制8人，2个岗位，专注于流行病的研究与防治，以及皮肤性病的控制工作。
5. 计划免疫科：编制6人，2个职位，负责免疫规划的实施和疾病预防接种管理。
6. 慢性病防治科：编制8人，2个岗位，致力于慢性疾病的预防和管理。
7. 公共卫生预防监测科：编制8人，同样配置2个职位，进行公共卫生状况的监测和预警。
8. 工业与劳动卫生防治监测科：编制6人，2人配置，关注工业健康和劳动卫生问题。
9. 理化检验科：编制12人，2个职位，负责实验室的理化检验工作，确保数据的准确性和可靠性。
10. 微生物检验科：编制12人，同样2个岗位，专注于微生物的检测和研究。
11. 消毒科：编制8人，2个职位，确保公共卫生环境的消毒与清洁。
12. 预防保健门诊部：编制15人，3个岗位，提供预防保健服务，包括健康咨询和疾病预防接种服务。
阳泉市疾病预防控制中心是阳泉市卫生局管理的正县级财政拨款事业单位。