厦门工商旅游学校设有多个专业部门，以满足不同领域的需求。信息部机电专业部专注于机械和计算机教育，配备一流的多媒体计算机机房、网络教室和各类实训设施，师资力量雄厚，提供计算机应用与管理、计算机网络技术等专业，毕业生就业情况良好。
汽车部作为学校的重要系部，拥有高素质教师团队和先进的教学设施，如汽车检测与维修实训基地，教学水平领先，毕业生就业率保持高位。汽车部注重实践能力培养，积极与企业合作，提升学生职业技能。
旅游专业部是学校的教学核心部门，涵盖了旅游管理、酒店管理等多个专业，师资力量强大，注重学生综合素质的培养，通过实习与就业安排，毕业生深受行业欢迎。
商业部由财经商贸类专业整合而成，提供电子商务、物流管理等专业，致力于培养具备综合能力的商业人才。商业部与企业紧密合作，通过模拟实训和双证融合，为学生就业打下坚实基础。
财会专业部专注于财务会计教育，培养初级应用型技能人才，以就业为导向，提供模拟实训和职业技能鉴定，确保学生具备扎实的理论与实践能力。
基础部负责学校的基础课程教学，注重人文精神与专业技能的结合，致力于提升学生的文化素养和综合能力。
厦门工商旅游学校是2008年新组建的中专学校。由厦门商业学校、厦门旅游职业中专学校、厦门市交通职业中专学校共同组建了厦门工商旅游学校，是国家级重点中专学校，是厦门经济特区唯一的一所全日制财经类中专学校。学校办学理念先进，以服务为宗旨、以就业为导向，以培养实用型人才为目标，面向社会办学，形成了集学历教育、短期培训为一体的多层次、多渠道的办学模式，走出一条以特色求生存，以改革促发展的成功之路。