有不少人认为，便秘只不过是一种无关痛痒的小毛病。因此，即使患了便秘，也总觉得没有必要去求医问药。其实，便秘对人体健康有很大的危害。
人体通过消化系统每天摄取大量的食物、水分和其它营养物质，经过复杂的转换过程变成机体生长活动所需的成分，同时排出代谢废物和有害物质。大便中有大量的食物残渣，其中超过50都是细菌，如果长时间保留在体内无法排出，将产生大量的有害气体和毒素，通过结肠黏膜重新吸收进入肝、脑、肾等重要器官，对人体危害极大!便秘作为消化系统最常见的功能障碍，不会立即威胁到生命，并且采用泻药或灌肠的办法能快速的度过难关，这直接导致了便秘长期被社会和医学界所轻视，也是便秘危害的根源所在。
一、对消化系统的危害
1、胃肠神经功能紊乱：便秘患者，因粪便潴留，有害物质直接作用于肠道，以及吸收入血可引起胃肠神经功能紊乱，导致食欲不振，腹部胀满、嗳气、口苦等表现。若肠道细菌对蛋白质分解增多，产生气体过多，可诱发或加重各种急腹症，如穿孔、阑尾炎、肠梗阻等。
2、腹泻：便秘时，因粪块嵌塞于直肠腔内难以排出，但排便时有少量的水样粪质可绕过粪块自肛门流出，祖国医学称之为“热结旁流”。若不能认识到其根本原因是便秘，而按腹泻论治，可加重病情的发展。
3、腹痛：便秘所致腹痛在儿童较多见。腹痛无规律，呈阵发性反复发作，每次发作持续数分钟至数十分钟，疼痛部位不固定，可位于脐周、全腹，疼痛性质轻重不等，间歇期无异常表现。其原因尚不明确，可能为直肠内大量硬性粪块堆积，刺激肠壁感受器，引起肠道肌肉强力的反射性收缩，而出现阵发性腹痛，间歇期肠壁肌肉松弛，腹痛缓解。
4、肛门直肠疾病：排便困难，粪便干燥，大便不爽等便秘症状可诱发或加重肛门直肠疾病，如肛裂、肛周脓肿、痔病、外伤性直肠炎等。便秘患者由于粪便干结，粪块巨大，加之排便努挣，可直接导致肛管皮肤撕裂，而产生急性肛裂，周期性的便秘与疼痛是肛裂的主要特点。粪便干结、反复使用泻剂，易损伤肛窦、肛腺组织，产生肛隐窝感染，进而发展为肛周脓肿、肛瘘。
5、恶性肿瘤：肠道内存在众多的“坏细菌”，如威尔斯菌等可分解部分食物残渣，产生亚硝胺等致癌物质以及促进癌细胞生长的苯酚、吲哚等。对于便秘患者，此类有害物质不能及时有效的排出，而长期大量的积聚于肠道内，直接作用于肠道粘膜而诱发肠道肿瘤发生，部分毒素吸收入血，进入其它组织器官，亦可诱发肿瘤的发生。据资料显示，严重便秘者约10患结肠癌。美国加利福尼亚大学的医学家在研究乳腺癌的发生情况时，发现便秘是乳腺癌的“元凶”。研究者发现，排便正常者乳腺细胞发育异常的只占5，而便秘者却高达23。乳腺癌的先兆症状常是乳腺和导管上皮的不典型增生，而便秘者的乳腺正是这种增生。
二、对循环系统的危害
1、诱发心脏疾病急性发作：便秘合并心血管疾病患者，常因排便努挣而造成意外。排便努挣，主要是兴奋副交感神经，促进胃肠的蠕动及消化腺的分泌，此时交感神经受抑制，心跳减慢减弱、血压下降。大便排空后，因交感神经较长时间受到抑制，故排便后出现交感神经反射性兴奋，导致心脏兴奋性加强，心率加快，微动脉收缩，血压升高，冠状动脉压力增高，血管被迫扩张，心肌耗氧量增加，因而可诱发冠心病急性发作，患者常常因为粥样斑块处冠脉破裂致死。此外，还可诱发心律失常、心力衰竭、高血压危象等。
2、诱发脑血管疾病发作：便秘合并脑血管疾病患者，常因排便困难诱发脑血管意外，其中脑出血是最常见的，其机理主要为排便努挣，大便排空后，交感神经反射性兴奋，微动脉收缩，血压升高，出现脑血管粥样斑块处破裂而致脑出血。
三、对神经神经系统的危害
肠道细菌能将未消化的蛋白质分解为氨、硫化氢、组织胺和吲哚等有毒物质，若这些有毒物质不能及时随大便排出体外而滞留于肠道内，会不同程度地被吸收入血经过肝脏进行解毒。当这些有毒物质日积月累，超过肝脏的解毒能力时，便会更多的随血液循环而到达全身。其中，有毒物质通过血脑屏障进入大脑后，可逐步侵害脑细胞和中枢神经，而出现智力下降，记忆力减退、注意力分散、思维迟钝等，甚至可以诱发老年痴呆。
四、对皮肤的危害
便秘患者，大量的毒素被吸收后，经过肝脏的解毒，需要从泌尿系统和皮肤汗腺系统排出，加重了皮肤汗腺系统废物的堆积;此外，不能被肝脏清除的毒素随血液进入皮肤组织后，对其产生直接毒害作用，加速皮肤的衰老。临床常见患者皮肤晦暗、无光泽、粗糙、色素沉着，出现痤疮、色斑、黄褐斑等，影响患者的容颜。
五、对泌尿生殖系统的危害
便秘可导致儿童遗尿，直肠的膨胀可刺激膀胱收缩，产生膀胱刺激症，反复的刺激，可产生不可控制的收缩，而产生遗尿。慢性顽固性便秘患者，每次排便蹲厕时间长，腹压持续时间长，对盆底器官的压力大，直接干扰了盆底其它器官的功能，如前列腺、子宫等，对于男性患者，可导致性功能障碍，长时间把精力集中于排便过程，还可出现性欲减退，性冷淡等，对于女性患者，可发生痛经、阴道痉挛、尿潴留、尿路感染等。
六、对精神心理的危害
便秘患者，体内毒素的吸收增加，可导致神经内分泌功能紊乱，大便得不到及时、规律的排出，导致肠神经系统功能紊乱，而出现精神情绪失常，如情绪低沉，郁郁不欢，注意力不集中、急躁易怒，打人毁物等，随病程迁延逐渐加重，甚至导致精神发育迟缓、焦虑症、强迫症、抑郁症，严重时可有强烈自杀倾向。此类病人往往有较低的疼痛耐受力和对外科手术的追求欲。精神心理的障碍反过来可以加重排便困难，从而进入恶性循环。
七、危害社会的和谐发展
1994年3月8日美国纽约爆发一起“马桶游行事件”,有132位女市民，每人搬一个马桶，蹲坐在市政厅广场要求解决便秘治疗问题，震惊世界。便秘的患病率长期居高不下，因长期得不到各方面的重视，如前所述，对患者的身体健康产生了多种危害，降低了患者的生活质量，影响了患者的工作，加重了家庭经济负担，破坏了家庭的和谐，干扰了以患者为中心的社会群体。大量的便秘患者得不到合理的诊治，直接阻碍了社会的和谐发展。便秘已然成为一个社会问题。
对于便秘，目前在医学界仍有很多争论，对其诊断与治疗尚未统一，很多医生甚至认为其不是一种病，而是单纯的排便困难症状，而普通民众对其认识则更是空白了。根据目前的最权威的诊疗指南，确诊为便秘需要完成多项检查项目，很少患者能坚持完善所有检查，不少患者在花费了大量时间、金钱去完善部分检查后，却被告知没有“病”，但是排便困难的症状却长期存在，并影响着生活工作，部分患者行单一检查后，就被武断的下诊断，并且行相应治疗，结果是有的患者便秘短暂的缓解，有的甚至无明显变化。以上情况的出现，直接加重了患者的经济、心理负担，同时使患者陷于深深的困惑之中，也是家庭、社会矛盾的根源之一。