口袋妖怪漆黑的魅影第二个世界在打完四天王后去水镜市上面的魅影大厦找人说话，说完之后来下面这里：
小智和小茂的秘密基地：通关后的115号道路，流星瀑布出口。
渡的秘密基地：通关后的120号道路。
希罗娜的秘密基地：通关后的119号道路，气象研究所右下方冲浪，再往右下方走。
阿戴克和艾丽丝的秘密基地：通关后的111号道路，沙漠上方。
打完全部人之后回到大厦，触发剧情并回去联盟击败挑战者就会回到现实世界，回去之后过完一堆剧情后去古辰镇上面的水路右边有个新开的洞，进去左上角击败邻居并拿到白羽毛。然后去天元森林右边找到朋友，击败他，然后一直往里面走看到玻璃柜拿黑羽毛。然后回去实验室就会自动到世界借口，走左下角就会到第二个世界。