第一点：专业型硕士与学术型硕士的培养方向是不同的。
学术型硕士培养的主要是研究理论知识的研究型人才，而专业型硕士培养的主要是实用型人才，这类人才是操作型人才，非常具有职业性，以实践为导向，重视实践和应用。总结来说就是一句话，那就是：学术型硕士搞理论研究，专业型硕士搞实际。
第二点：导师制度不一样
专业型硕士有两个导师，一个是在学校内部指导的导师，主要负责教授理论知识，学术指导工作；另外一个是校外导师，主要负责培养技能，指导实践。而学术型硕士实行的是一个导师制度，也就是说学术型硕士的导师只有一个，主要对学生的理论知识，课题项目进行指导。
第三点：考试科目难度不同
对于大部分工科专业来说，学术型硕士在报考的时候考的是数学一、英语一，而专业型硕士在报考时考的是数学二、英语二。数学一与数学二的区别在于数学二不考概率论，难度相对数学一来说简单不少；同样，英语二也比英语一的难度小不少。
第四点：调剂条件不同
报考学术型硕士的同学如果遇到某些原因的话可以调剂到相同或者相近专业的专业型硕士，但是专业型硕士不可以调剂到学术型硕士的行列。但要注意临床医学类专业硕士调剂要求则相反。报考临床医学类专业硕士研究生的考生可按相关政策调剂到其他专业，报考其他专业（含医学学术学位）的考生不可调剂到临床医学类专业学位。
第五点：学费不一样
根据国家教育部规定学术型硕士每年每人的学费为8000元/年，而专业型硕士的学费一般在12000元/左右，工学学费要不大于12000元/年，金融学则要贵很多。
第六点：学制不同
学术型硕士一般为3年学制，但是专业型硕士一般为2到2年半的学制，也有的为3年，具体情况按照学校的标准而定。
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