关于龙游石窟的多种猜测，涵盖了陵墓说、采石说、屯兵说以及外星文明说。首先，陵墓说依据《徐偃王庙碑》提出，但存在诸多疑问：为何没有皇族遗物？为何石窟结构单一，无分隔痕迹？为何没有生活遗迹？石窟的进出设计是否考虑过自然灾害？
采石说认为是废弃石窟，但露天开采更为经济安全，为何选择地下作业？石料易风化，为何投入巨大工程开采？为何没有留下设备痕迹？废弃洞窟为何还要规则修饰？
屯兵说认为是越王练兵地，但耗时过长且风险大。为何不担忧破坏？石窟内部如何解决照明？进出不便与兵家策略不符。为何没有战斗痕迹？
最后是外星文明说，UFO研究者认为石窟可能是外星遗迹。然而，这需要大量外星人参与，且石窟的规则凿痕更像是地球工程。外星挖掘目的不明，居住或采集元素都不符合理性。
龙游石窟是我国古代最高水平的地下人工建筑群之一，也是世界地下空间开发利用的一大奇观，它是中华民族博大精深的体现，集人文、艺术、文化、工程技术于一体，因此，1992年，世人传说中的"无底塘"在四个当地的农民的隆隆水泵声中"水落石出"。这些石窟的断代成因和用途更是众说纷坛，成为难以破解的千古之谜，也被当地人称之为"世界第九大奇迹"。